我要做有机分子在晶体表面的吸附行为研究。晶体超晶胞已经优化完毕了,下一步是优化有机分子。我的做法是将超晶胞内的晶体原子全部删掉,晶格参数固定,然后将要研究的有机分子放进去。 参数设置如图 计算的时候有个有意思的现象,就是将分子放入晶胞,体系电荷为0时,可以收敛。但是如果将有机酸分子去掉2个氢原子后...
在网上下载了β-CD的结构后,在guassview中手动改成下图结构,但是改完之后不对称。请问怎么把它优化成完全对称的结构呢?自己试着用guassview进了了opt运算,出现了error。打开error的运算结果的结构,分子变成椭圆形了 分子模拟 MS
各位大神，请问MS中利用不同力场和电荷对原始晶胞进行优化后的结构该怎么分析呢？
DMol3 Analysis->Potentials
直接将原子复制粘贴
结构优化本来就是 让体系变成一个合理的构型 图2是合理的 如果想让真空依旧存在 自己想法子吧 好的...
各位大神，请问MS中利用不同力场和电荷对原始晶胞进行优化后的结构该怎么分析呢？
各位大神，请问MS中利用不同力场和电荷对原始晶胞进行优化后的结构该怎么分析呢？
各位大神，请问MS中利用不同力场和电荷对原始晶胞进行优化后的结构该怎么分析呢？
想通过Forcite对LiF晶体进行结构优化。我看有两三篇文献中使用的是Compass力场。可是我在使用Compass力场...