MSigDB全称为The Molecular Signatures Database，是一个由数万个注释基因集的资源，用于GSEA软件，分为人类和鼠的集合。在MSigDB网站中，选择需要的基因集，如内质网应激相关基因集GOBP_RESPONSE_TO_ENDOPLERMIC_RETICULUM_STRESS。登录MSigDB官网，网址为gsea-msigdb.org/gsea/ms...，点击search后输入邮箱...
MSigDB全称为The Molecular Signatures Database,中文翻译过来是分子标签数据库,是一个由数万个注释基因集的资源,用于GSEA软件,分为人类和鼠的集合。 二、使用MSigDB数据库下载数据 小果以下载内质网应激相关基因集为例,进行下载演示 GOBP_RESPONSE_TO_ENDOPLASMIC_RETICULUM_STRESS 1.进入MSigDB官网,网址为:https://www...
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Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)是由Broad Institute研究所的科学家提出的一种富集方法,在提出该方法的同时还对应提供了分析的软件GSEA和一个基因集数据库MSigDB(molecular signatures database)。MSigDB数据库收集了有良好注释的基因集合,是分析基因富集通路的宝藏数据库。在MSigDB官网上可以通过关键字搜索基因集、按...
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