用Windows下的Material Studio建立了分子模型,需要转换成lammps可以计算的data文件。 方法比较详细且小白,自己忘了可以回来看看。 一、命令行方法 # ---Windows版本命令行cmd方法--- #在MS建模后,用Modules > Forcite 模块选择 cvff_力场进行结构优化,优化后File > export输出.car 文件,将输出的car和mdf文件拷贝至...
MS导出的data文件格式 另一个需要注意的是导出的Atoms信息是full原子类型查找lammps官网中"read_data"找...
偷懒的MS转LMP文..随着Ovito的大更新进入3.0.0兼容各种DFT软件,以及反应力场(包括不限于Reax,MEAM,AIREBO,各种Tersoff,SW,Vashishta)的各种应用,我们几乎可以告别msi2lm
LAMMPS/DL_POLY » 【求助】将MS数据文件转化成lammps data26 126152/3 返回列表 上一页 1 2 3 查看: 5771 | 回复: 25 只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏 在APP中查看 相关版块跳转 分子模拟 我要订阅楼主 xscxscxsc 的主题更新 ...
MS氢气建模并转换为lammps data文件 前一次推文给出了氢气压缩模拟(lammps案例:npt系综练手,H2压缩模拟),有同学咨询氢气建模方法,本文简单介绍一下氢气建模步骤: (1)在MS中新建模型文件,点击添加H原子按钮,在中间工作区连续点击2次,画出H2分子。 (2)使用AC模块建立含有500个氢气分子的模型。
也可以先转为xyz或者pdf，再用atomsk读取，转换为约会文件 发自小木虫Android客户端
在MS建模后,需要使用msi2lmp把car类型的文件转为lammps data文件,具体的方法已经介绍过多次: 但是,有时候模型在ms中显示没有问题,但是转换为data文件后结构会发生变化。 如下图模型是在ms中建立的纳米流体的一个模型: 转为data文件后,结果为: 本来三层的结构,现在变成了4层。
MS建立的模型中含有高分子聚合物和无机物，导出car文件后使用LAMMPS中的msi2lmp工具转化为data文件，试了...
使用MS建模在LAMMPS建模中颇为重要，但转换至DATA文件过程中会遇到多种错误。MS模型转DATA文件流程分为两个步骤，首先是MS建模、设置力场并导出CAR文件，其次是MSI2LMP将CAR文件转至DATA文件。任一环节出现错误将阻碍DATA文件生成。forcite力场设置环节是最常见的出错点。forcite设置力场错误原因多样。首先，...
有偿请教如何把MS里面的沥青模型转成data文件,微信1583760734 只看楼主 收藏 回复 时光能静止 初级粉丝 1 贴吧用户_QtA6AN1 初级粉丝 1 私,专业做 畅想的新世纪 初级粉丝 1 下个ovito,用ms保存为(export)为cif文件再用ovito打开保存为(export)为lammps的data文件...