mRNA-seq(伯豪生物提供技术服务) 方法 在本研究中,实验室合成了一种用于肌腱断裂再生的压电弹性体(piezoelectric elastomer for tendon rupture regeneration, PETRR)。PETRR具有低至0.3MPa的弹性模量和高达300%的可恢复应变。这些特性使PETRR能够随着跟腱进行长期往复运动,实现对肌腱断裂和局部温度变化的实时传感。在大鼠...
另外,Kaplan-Meier对来自CRC数据集GSE41258和GSE71187的数据的分析表明,高eIF3f水平与较差的存活率相关(fig 1B)。qRT-PCR分析显示,结直肠癌组织中EIF3F的mRNA水平高于癌旁正常黏膜组织(fig 1C)。与正常上皮细胞系(NCM460、GES-1)相比,eIF3f在所有大肠癌细胞系(HCT-116、RKO、HCT8、HCT15、DLD-1、HT29、SW...
导言对转录组mRNA-seq的结果通过差异分析后得到基因的FC和p value值之后,会进行进一步的GO/KEGG基因集富集分析和GSEA富集分析流程;上述差异分析可以拿到几百甚至上千个差异基因,为了处理这些高维数据,需要借助生物学相关的降维方法(例如依赖于生物学相关的基因集),进一步进行数据筛选。基因集富集分析可以确定一组感...
对于RNA-seq来说,鉴于序列的随机性打断和G/C、A/T含量分别相等的原则,理论上每个测序循环上的GC含量相等、AT含量相等(如果是链特异性文库,可能会出现AT分离和/或GC分离),并且在整个测序过程基本稳定不变,呈水平线。但在现有的高通量测序技术中,反转录成 cDNA 时所用的6bp的随机引物会引起前几个位置的核苷酸组...
【答案】: 转录组学(transcriptomics)是在基因组学后新兴的一门学科,即研究特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA(包括mRNA和非编码RNA.的类型与拷贝数。Illumina提供的mRNA测序技术可在整个mRNA领域进行各种相关研究和新的发现。mRNA测序不对引物或探针进行设计,可自由提供关于转录的客观和...
,通过 mRNA-seq 对前列腺癌( Prostate cancer,Pca )诊断的新型非侵入性生物标志物。研究建立了一种新的 emRNA 研究策略,为液体活检相关 emRNA 表达谱进行检测,并最终确定 6 个 emRNA 作为用于 PCa 诊断的新型非侵入性生物标志物。研究建立了一种新的 emRNA 研究策略,为液体活检研究提供了一种新的思路。
RNA水平存在化学修饰已在上个世纪就被人们普遍报道与研究,其中mRNA最常见的修饰莫过于N6-甲基腺苷(m6A)甲基化了,在人和小鼠体内有超过三分之一的mRNA存在修饰。 最近的研究表明,在植物中的mRNA水平上,m6A的甲基化调控也出现在许多生物过程中。这个过程中的m6A甲基转移酶(在特定位置加入m6A修饰)、m6A去甲基化酶(将...
RNA-seq(伯豪生物提供)等机制实验发现,RKH通过与TLR(Toll样受体)互作,抑制TLR通路激活,降低巨噬细胞产生细胞因子风暴的能力,从而改善败血症患者的生存质量和预后生存。该研究发现了一个新型的三肽RKH,可以抑制TLR活性,有希望成为败血症患者的新型治疗方法。
伯豪技术服务:RNA-seq 研究背景 脓毒症是由宿主对感染反应失调引起的危及生命的器官功能障碍疾病,占全球报道死亡病例的20%。由于免疫反应失调,常伴随细胞因子风暴、免疫抑制、代谢失调、器官功能衰竭,最终引起死亡,相关临床研究及药物治疗收效甚微,因此急需寻找新的提升患者预后的治疗方法。
报告解读 | 转录组mRNA-seq报告解读(二) 前言 转录组作为研究基因表达的利器,已经成为实验室的常用工具。那么拿到转录组的数据之后,动辄就有几十页的分析报告,几十项分析内容。每个图表的含义是什么,哪一些分析内容是需要重点关注的呢?真正可以用到文章里的分析内容又有哪些?