mRNA和miRNA联合分析 GEO数据的分析GEO登录号:GSE16759 mRNA结果分析 mRNA结果 miRNA结果分析 miRNA结果 miRNA筛选 2-2 mRNA筛选 1-1 批量预测miRNA靶基因http://diana.imis.athena-innovation.gr/ 网页:http://diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=microT_CDS/index GPL8757 miRbasehttp:/...
分析到现在,基本确定了CRC相关的miRNA-mRNA调控网络,为了进一步验证分析结果,作者挑选了6个上调的miRNA和4个下调的mRNA。之所以挑这几个,是因为他们都已经被报道参与了Wnt信号通路。不仅可以验证数据筛选的结果,还能验证Wnt信号通路是否真的与CRC相关,这就是一箭双雕啊朋友们。 作者对挑选的这些基因在CRC组织和正常组织...
该模块专门用于分析RNA的降解模式,包括miRNA-mRNA和miRNA-ncRNA两个子模块,主要是针对miRNA介导的降解片段进行测序,从而筛选和鉴定miRNA调控的靶基因,使预测结果具有更高的准确性。 这里小编以hsa-miR-107为例说明miRNA-mRNA模块的用法。首先在页面左侧选项栏中设置条件。 条件全部设置好后,页面会自动跳转预测结果,如下...
需要金币:*** 金币(10金币=人民币1元) 常用的数据库操作演示2mrna和mirna联合分析及network绘制.pptx 关闭预览 想预览更多内容,点击免费在线预览全文 免费在线预览全文 出发的研究 DianaTools/index.php?r=microT_CDS/index :/// 感谢您的观看 下载文档 ...
通过FunRich软件对筛选的差异miRNA进行靶标预测,并与筛选的差异mRNA取交集得到共有差异基因.通过R语言"clusterProfiler"包对共有差异基因进行富集分析和通路注释以挖掘其生物学功能.运用string数据库和cytoscape软件进一步构建miRNA-靶基因调控网络,并鉴定分子网络中的关键基因分子.结果 共筛选鉴定出167个共有差异基因.富集...
STRING数据库构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络,对前20个枢纽基因进行表达验证和生存分析.结果对375例HCC样本,50例癌旁样本进行差异miRNA分析,共鉴定出300个差异表达的miRNA.对374例HCC样本,50例癌旁样本进行差异mRNA分析,共鉴定出1106个差异表达的mRNA.分别在上调的和下调的miRNA中选择20个差异表达最显著的miRNA预测...
1.基于生物信息学方法构建类风湿性关节炎miRNA-mRNA调控网络2.基于GEO数据库整合miRNA-mRNA表达谱筛选卵巢癌的关键基因分子及生物信息分析3.基于TCGA和GEO数据库构建胃癌ceRNA调控网络4.基于GEO数据库的卵巢癌ceRNA调控网络构建及相关lncRNAs的筛选5.基于生物信息学方法构建重度抑郁症发病的miRNA-mRNA调控网络 因版权原因,...
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百度试题 题目TCGA 数据库主要收录各种人类癌症的数据类型有 A.临床数据B.基因组变异数据C.mRNA表达数据D.miRNA表达数据相关知识点: 试题来源: 解析 A,B,C,D 反馈 收藏
分析到现在,基本确定了CRC相关的miRNA-mRNA调控网络,为了进一步验证分析结果,作者挑选了6个上调的miRNA和4个下调的mRNA。之所以挑这几个,是因为他们都已经被报道参与了Wnt信号通路。不仅可以验证数据筛选的结果,还能验证Wnt信号通路是否真的与CRC相关,这就是一箭双雕啊朋友们。