研究团队鉴定出由剪接体组装在外显子边界上游的外显子拼接复合体(EJCs),这一新发现确认了m6A修饰与mRNA的剪接和稳定性关联。 研究者选择了6,897个HeLa m6A位点和3,058个未甲基化DRACH位点在HeLa细胞中进行测定,并验证了测定的精度和...
对γδ T17细胞进行m6A-RIP-seq分析。γδ T细胞mRNA长度的m6A位点的宏基因谱(C)。维恩图(D)显示了RNA-seq中差异表达基因的重叠(上和下,差异p值< 0.05)和m6A-RIP-seq中m6a修饰的转录本。热图的502(360 + 142)差异表达基因m6A修改(E)所示。重叠502个差异表达基因受到KEGG通路分析,显示十大通路(F)。综合...
通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对,导致在m6A位点附近发生片段化或突变,最终以单碱...
N6-甲基腺苷(m6A)是 mRNA 中最常见的化学修饰,其在特定的 mRNA 中富集,并发挥着调节细胞生长、分化和细胞应激反应的重要作用,m6A 是由包含 METTL3 和 METTL14 的异二聚体甲基转移酶在 mRNA 上合成的。m6A 的主要作用是促进 mRNA 的降解,因此,携带 m6A 的 mRNA 通常维持在较低水平,而这些 mRNA 中的...
研究者进一步分析了RUNX2发生m6A修饰并导致其mRNA稳定性降低的位点。发现其3’-UTR的第二个m6A修饰位点对其mRNA稳定性具有显著影响。(图4) 图4YTHDF2识别Runx23′UTR区域中的特定m6A修饰位点 研究者进一步在大鼠的血管钙化模型中验证了M...
前期研究表明,ECT8会招募m6A修饰的mRNA来响应ABA形成SGs,并且在ect8-1突变体SGs中呈现低甲基化和表达下调的mRNA包括PYL7(该基因编码一种能高亲和力结合ABA并增强抗旱能力的ABA受体)。PYL7转录本的3'非翻译区含有一个高可信度的m6A修饰位点(ATTTm6ACGCA)(图4a)。通过跨越该位点的引物进行m6A免疫沉淀-qPCR(m6A-...
N6-甲基腺嘌呤(m6A)是哺乳动物mRNA内部最常见和研究最为广泛的修饰,对于多种生理学和病理生理学过程中的基因表达有着广泛深刻的影响。在转录组中存在着数万个m6A位点,参与调控mRNA代谢的多个步骤,包括前体mRNA处理、转运出核、降解和翻译 【1, 2】。m6A经METTL3/METTL14甲基转移酶复合体特异性地催化组装在...
1、细胞mRNA中m6A位点的原位可视化 In situ visualization of m6A sites in cellular mRNAs Nucleic Acids Research; IF: 14.900; DOI: 10.1093/nar/gkad787 内容概要: ① 开发了一种原位可视化靶向RNA中特定N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)位点的方法—DART-FISH,能同时检测m6A修饰和未修饰的转录本拷贝。
4、m6A Writing转录和位点特异性机制 (a)N6-甲基腺苷(m6A)Writer复合物到特定转录本的募集模型。 上图展示了两种模型:模型1中m6A Writer复合物募集到DNA基序是由转录因子介导的。模型2中通过组蛋白修饰(例如组蛋白H3赖氨酸36三甲基化(H3K36me3))引导m6A Writer复合物募集到特定的DNA位置。