其实这个网站就是“TwoSampleMR”包所依赖的数据库,将它和“TwoSampleMR”包结合使用可以达到事半功倍的效果。 假设我们现在想寻找BMI(body mass index)的GWAS数据,可以在搜索栏里输入“body mass index”然后回车(如下图所示): 返回的结果如下图所示,这里我们需要关注标红的“GWAS ID”这一栏,它直接告诉你这个...
接下来,我们点击“ukb-b-19953“这个数据集,可以发现它提供了VCF文件,其实这也就相当于提供了完整的数据,大家可以点击”View report“查看结果报告: 看到这儿,我想大家也明白了,这个数据库里的完整GWAS数据可以通过下载VCF和index文件得到,如果没提供VCF文件的,那说明它的完整GWAS summary数据不是公开的或者需要到别处...