RadialMR_r1<-egger_radial(r_input=mydata,alpha=0.05, weights=1,summary=TRUE) plot_radial(c(RadialMR_r,RadialMR_r1)) 结果如下: 随手跑了一个蛋白和疾病没想到这么显著。Effect(1st)是效应值,后面迭代计算2次。 找出具体SNP: which(RadialM...
MR radial plot--一条径向曲线以突出显示每个遗传变异的比率估计值以及总体 IVW 估计值 ??plot_radial---A function for producing radial IVW and MR-Egger plots either individually or simultaneously. The function allows for a variety of aesthetic and scaling options, utilising the output from theIVW_...
AI代码解释 library(ggplot2)# 散点图plot1<-mr\_scatter\_plot(mr\_results1,mydata)plot1# 单个SNP森林图res\_single<-mr\_singlesnp(mydata,parameters=default\_parameters(),single\_method="mr\_wald\_ratio",all\_method=c("mr\_ivw",'mr\_two\_sample\_ml',"mr\_weighted\_median"))sign...
data) p1_1森林图（forest plot）森林图用来展示每个 SNP 的因果效应估计值及其置信区间，主要看总效应...
mr_scatter_plot(res,mydata) 这里的res就是函数mr()运行出来的MR结果,而mydata则是harmonise_data()函数的结果。 这幅图上每一个点其实代表的就是一个IV,每个点上的线实际反映的是95%置信区间,横坐标是SNP对暴露(BMI)的效应,纵坐标是SNP对结局(二型糖尿病)的效应,彩色的线表示的是MR拟合结果。从图中我...
Theplotly_radial()function produces interactive radial plots corresponding to the output of theivw_radial()andegger_radial()functions. Theplot_radial()function produces a radial plot corresponding to the output of theivw_radial()andegger_radial()functions. The function provides a range of scaling...
1-to-many forest plot 例1 例2 多变量MR(MVMR) MR-MoE 整合所有结果 安装 remotes::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR") overview 使用TwoSampleMR进行MR分析主要就是4步: 为暴露因素选择合适的工具变量(必要时进行连锁不平衡的过滤) 对感兴趣的结局提取工具变量 ...
将二维数据变成三维数据的过程,称为将数据投射到高维空间.,这正是SVM算法的核函数(kernel trick)功能. 在SVM中用的最普遍的两种把数据投射到高维空间的方法分别是多项式内核(Polynomial kernel)和径向基内核(Radial basis function kernel,RBF). 1.SVM支持向量机的核函数 ...
感兴趣的领域 #C/C++#Java 近期文章 如何理解PID控制的直接实现方案的潜在问题时积分器饱和 横向/纵向自动驾驶仪设计过程 【MATLAB】实现寻找十六进制中的特定字符 电机的分类(1) 【Matlab】矩阵中选取任意子矩阵 2024年 3篇2023年 33篇2022年 39篇
Radial MR: A package for implementing radial inverse variance weighted and MR-Egger methods 导入数据 library(RadialMR)View(data_radial) 1. 分析 1.1 egger_radial Example using format_radial data ldl.dat<-data_radial[data_radial[,10]<5*10^-8,]ldl.fdat<-format_radial(ldl.dat[,6],ldl.dat...