这个是Yang lab对SMR software的简洁,大概意思是,我这个算法开发出来就是计算基因表达水平和一个trait的之间的水平多效性的。工具变量用的是eQTL。 这里他提到的一个算法是SMR & HEIDI,后面我们详细看下。这个算法的目的是解释一个SNP对表型的影响是否是由基因表达水平介导的。【这点我暂时没理解到位,等读完paper再...
①什么是药物靶点:药物与机体生物大分子的结合部位即药物靶点。 ②药物靶点MR:药物的作用方式有很多,在药靶MR中,我们主要研究的是对于蛋白的调节的情况。(蛋白即功能)。 3.QTL ①QTL:全称是Quantitative Trait Loci。顾名思义就是基因组上的一些位点,对一些特定性状具有某种量化的影响。 ②eQTL:表达数量性状位点,...
Q值进行异质性检验，检测数据点是否存在偏差，通过卡方分布计算P值。综上所述，选择SMR或TSMR方法取决于具体研究目标和数据特性。SMR关注于基因表达水平与表型之间的中介作用，而TSMR提供了一系列计算因果效应的方法，包括wald ratio和IVW算法，适用于不同数据结构和分析需求。因此，在选择QTL孟德尔随机化方...
数量性状位点(Quantitative Trait Locus mapping,简称 QTL 定位),指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。QTL可分为cis-QTL和trans-QTL。其原理就是测定一群个体的某个数量性状(表型),以及它们的基因型(就是基因组上的一些遗传标记,例如SNP),然后寻找基因型和表型的对应关系。eQTLeQTL(expression QTL,基因表达...
肠道组织与肠道微生物直接接触,并感知OS水平的局部变化;因此,作者假设整合来自肠道组织的顺式eQTL和mbQTL将提供具有假定的宿主-微生物群相互作用的新的候选靶标。首先,对从 GTEx 项目 (n = 860) 获得的三种肠道组织的 cis-eQTL 数据进行了荟萃分析,调整了样本重叠。随后对来自1000IBD项目的肠道顺式eQTL数据进行了...
高通和骁龙平台带来的创新将助力实现云边融合，变革众多行业，加速数字经济发展，并改变我们体验世界的方式，创造更加美好的生活。高通公司包括技术许可业务（QTL）和我们绝大部分的专利组合。高通技术公司（QTI）是高通公司的全资子公司，与其子公司一起运营我们所有的工程、研发活动以及所有产品和服务业务，其中包括半导体...
如今的孟德尔随机化日新月异,个人绵薄之力实在是无法及时跟踪最新的进展,有时候也会囿于自己的学识无法带给大家完全可靠的知识。 比如最近在学习的药靶MR分析,也遇到了几个问题: 药靶基因的eQTL数据参考基因组是hg19,疾病gwas数据则来自于hg38,这个时候是不是要先将RSID转换为统一坐标(chr+position)?
投入资金约250万欧元,建设了行业内第一家获得国际认证标准SGS授权的QTL电动自行车实验室——ADO EBIKE QTL Lab。ADO Laboratory投入了先进的整车和零部件测试仪器和整车性能实验设备,测试方法均按照SGS国际标准机构的标准。整车在出厂前必须通过严格的质量检验,确保每一辆ADO EBIKE是符合国际标准的高品质产品。
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