1.2 安装devtools(R语言): install.packages("devtools") 安装devtools也遭遇失败情况,具体见无知小白:R语言中安装devtools失败及解决办法 1.3 devtools装monocle3(R语言): devtools::install_github('cole-trapnell-lab/monocle3') 2.遇到error如下: 2.1 error1: xlib-backend.c:34:10: fatal error: X11/Intrin...
ERROR: dependencies ‘batchelor’, ‘sf’, ‘spdep’ are not available for package ‘monocle3’ * removing ‘/usr/local/lib64/R/library/monocle3’ Warning messages: 1: In i.p(...) : 安装程序包‘sf’时退出狀態的值不是0 2: In i.p(...) : 安装程序包‘spdep’时退出狀態的值不是0 ...
首先,确保你已经安装了 remotes 包,因为我们将使用它来安装 monocle3 包。 install.packages("remotes")2.使用 remotes 安装 monocle3 接下来,使用 remotes 包从 GitHub 安装 monocle3 包: remotes::install_github("cole-trapnell-lab/monocle3")这将从 GitHub 下载和安装最新版本的 monocle3 包。3.安装 sf ...
PyMol是一个类似于VMD的分子可视化工具，也是在PyQt的基础上开发的。但是由于其商业化运营，软件分为了教育版、开源版和商业版三个版本。其中教育版会有水印，商业版要收费，但是官方不提供开源版本的安装方法。按照参考链接1的内容，可以在Windows系统上面安装一个开源版本的PyMol，但是该发行版只有Windows平台的编译包...
最近在做单细胞的学习,跑拟时序分析代码(cds<- cluster_cells(cds))的时候,莫名奇妙的Rstudio崩溃重启,本来以为python的原因,后来发现之前monocle3根本没有装上,神奇的是前面打代码可以运行!!!所以需要重新安装monocle3包。话不多说,上代码: if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("Bi...