那么如果是R4.3,总不能为了monocle降级吧,我们测试发现monocle 2.32.0 在R 4.3中Ordercell没有问题,BEAM有问题,所以对2.32.0也做了修改版,让其在R 4.3中运行无障碍。(注意了:包修改的是它本身的问题,如果是因为流程或者数据的错误,需要自行检查) 接下来走走monocle2的流程吧,这里为了方便,数据也小,我们直接包...
#monocle pieline function#pay attention---Seuratobject version 5.0.0ks_run_Monocle2 <-function(object,#seurat obj or expression matrix (建议数据格式转为matrix,如果数据量大转化为稀疏矩阵as(as.matrix(data), "sparseMatrix"))layer,#used when object is a seurat objassay,#used when object is a ...