什么是mNGS? 宏基因组/转录组高通量测序(metagenomics next-generation sequencing, mNGS)通过对临床样本的DNA或RNA进行鸟枪法测序,对样本中的全部生物基因组进行高通量测序,可以无偏倚地检测多种病原微生物(包括细菌、真菌、病毒、寄生虫、特殊病原体、耐药基因、毒力基因)。 传统的病原微...
毫无疑问,mNGS将病原一网打尽并在24h内出具报告,成为病原检测的一把利剑。mNGS不需要培养,直接对样本核酸进行高通量测序,能够快速、无偏差的检测临床样本中的全部病原。其检测流程可以分为5个步骤:核酸提取、文库构建、上机测序、生信分析与报告解读。 mNGS检测流程图...
什么是宏基因组二代测序(mNGS)(即metagenomicNextGenerationSequencing),这种检测方法是不基于培养,直接从环境/临床样品中提取全部微生物的DNA,利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。这是一种可广泛分析临床样本微生物组(细菌,真菌,病毒)的高通量测序方法。宏基因组二代测序,...
对照组130例患者送检痰、血及支气管肺泡灌洗液标本做常规的微生物培养,根据培养结果调整抗菌药物使用;mNGS组48例患者加做mNGS,根据mNGS检测结果调整抗菌药物的使用。最后以28天,90天死亡率为指标,mNGS组均显著低于对照组,说明在mNGS结果的辅助下,患者的治愈率显著更...
mNGS检测优势 为满足临床病原微生物的检测,进一步为疑难危重感染提供快速精准的诊断依据,全式金推出样本保存、宿主DNA去除、微生物核酸提取及DNA文库构建相关产品,提供宏基因组文库制备的上下游整体解决方案。 样本保存 TransGuard®Disposable Virus Sampling Tube ...
DR meta 病原微生物检测是利用宏基因组(mNGS)检测技术,一种非培养的检测方法,对临床样本直接进行核酸提取检测,广泛分析其中的微生物组信息;通过高通量测序、生物信息算法与数据库比对,病原宏基因组(mNGS)可以无差别鉴别细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原,为临床提供感染类型诊断、抗性基因的鉴定和传染病的防控等服...
在临床应用中,当标本来源于正常菌群定植或污染的部位时,耐药基因需从复杂多样的物种组成中明确来源菌种,此外检测到的耐药基因型与表型可能不一致,因此,当mNGS检测到可能存在相应的耐药基因时,需通过相应的抗生素敏感试验确认后,指导临床选择相应的治疗药物。
mNGS理论上能够对检测样本中的所有生物基因组进行无偏倚测序,在下呼吸道感染中应用广泛,包括感染病原体的诊断、预测病原体耐药性等。 1. 基于二代测序的mNGS 二代测序是一种高通量、短读长的分子测序方法,大多数二代测序方法在DNA合成同时进行测序,通过在DNA复制过程中捕捉具有特殊标记的核苷酸进行基因组测序获得序...
mNGS药敏预测模型,以机器学习为核心,纳入鲍曼不动杆菌关键耐药基因和耐药表型分析,成功构建mNGS-AST模型并具备强预测性和高稳定性,提供了分子水平快速检测药敏的可靠途径。 mNGS药敏预测模型的构建和验证 回顾性验证和前瞻性应用证实模型价值 mNGS-AST应用于临床诊断鲍曼不动杆菌药敏的价值从2个维度开展评估:回顾性...
传统的病原体感染检测方法就像是在河里钓鱼,而mNGS相比就像是一种高效的“撒网捕鱼”方法,它能够帮助我们在复杂的生物环境中找到那些可能导致疾病的病原体。这种方法特别适合于那些用传统方法难以诊断的感染性疾病,比如不明原因的发热、感染等...