因此,当二代测序技术应用于临床微生物检测后,他也是第967医院最早应用mNGS技术解决复杂肺部感染的专家之一,先后成功诊断并治疗包括脓肿分枝杆菌、结核分枝杆菌、烟曲霉、毛曲霉、隐球菌、腺病毒、人偏肺病毒和汉坦病毒在内的一系列复杂肺部感染病例。 病原微...
tNGS与mNGS的主要区别在于检测范围和特异性: 检测范围:mNGS不限制检测范围,只要达到一定丰度的病原体都可以检测到,而tNGS只能检测设计了探针/引物的病原,通常是几十到几百种。 检测灵敏度:tNGS通过靶向富集目标病原体核酸序列,可以特异性增加测序数据中目标病原体序列的数量和比例,提高对目标微生物检测的reads数和覆...
tNGS:测序数据量较少,因此成本较低,且检测效率较高。 mNGS:测序数据量庞大,因此成本较高,且检测效率相对较低。不过,随着测序技术的不断进步和成本的降低,mNGS的应用也变得越来越广泛。 应用场景 tNGS:主要应用于院内感染筛查、呼吸道感染、血流感染等临床检验领域。 mNGS:适用于各种感染性疾病的病原检测,特别是对于...
4. 综合评估与分析:mNGS 检出的病原序列数差异受众多因素影响,因此对于病原体临床意义的判断,应进行综合评估分析,建议由包括实验室技术人员、生信分析人员、临床主管医生、临床微生物专家、临床感染病专家组成的团队,结合患者的临床表现、影像学改变和其他实验室检测结果,共同商议决定;仍然难以确定时可以进行多学科(MDT)...
mNGS技术在医学中的应用也存在一定的局限性: 1. 操作复杂,对相关人员资质要求较高,整个流程涉及的仪器和试剂较多,标准化欠缺; 2. 虽然检测新型病原体更为迅速,但是与RT-PCR平均3~5h的检测周期相比,mNGS对于常见的病原体检测需要更长的时间; 3. 测序深度要求较高,成本...
mngs的shotgun技术原理 1. 环境样本采集:从特定环境(土壤、海洋、肠道等)收集包含多种微生物的样本。不同环境中的微生物群落差异很大,样本采集要确保能代表目标环境的微生物组成。 2. 提取宏基因组DNA:采用物理、化学或酶学方法,从样本中的各种微生物细胞中释放并纯化DNA。这一步得到的是环境中所有微生物基因组...
研究纳入51名患者脑脊液样本，其中34名为脑膜恶性肿瘤患者（包括肺癌、乳腺癌脑膜转移等），17名为非肿瘤患者。结果显示，mNGS-CNV技术在诊断脑膜癌变方面具有优异的敏感性和高特异性，与传统脑脊液细胞学相比无显著差异（p=0.18，kappa=0.650）。若将拷贝数异常（CNV）参考值调整为3Mb，敏感性可提升至76.47%。...
尽管mNGS不能直接用于艾滋病毒的检测,但它在辅助诊断艾滋患者合并其他病原体感染方面却具有独特的优势。例如,在艾滋病合并耶氏肺孢子菌感染的诊断中,mNGS表现出了高敏感度和高特异度。通过mNGS技术,医生可以准确地检测出患者体内的耶氏肺孢子菌,并辅助制定针对性的治疗方案,从而提高患者的治疗效果和生存率。
mNGS在临床实验室的应用前景广泛,尤其是对临床出现的未知病原体感染的筛查和确认,mNGS是最后可行的方案。但是,mNGS在临床的推广应用同样存在着困难,除了实验程序要求标准化和可重复外,生物信息学数据分析也至关重要。目前急需解决的问题包括人员技术能力、硬件要求、质量控制、流程标准化等。随着越来越多的临床实验室参与...
杰毅生物 mNGS 本地化检测全流程 方案详情 政府实验室产品解决方案 在面临新发突发疫情时,快速、灵敏、简便地对病原体进行鉴定,是控制疫情传播以及对患者进行及时、有效治疗的关键。mNGS 是一种不基于培养、无需假设的病原体核酸检测技术,具有检测周期短、准确率高、覆盖病原体范围广,可检测新发、罕见、多重病原...