MMFF和MMFFs分子力场是分子力学中常用的一类力场。MMFF代表Merck Molecular Force Field,是由Merck和Dermer等人于1990年代初开发的一种力场。它基于分子力学理论,使用草图简化方法生成分子的电荷分布、键长和键角等参数,并通过调整这些参数来更好地描述分子的结构和能量。 而MMFFs代表Merck Molecular Force Field with...
MacKerell, MMFF notes 1 Merck Molecular Force Field (MMFF) (Halgren, 1996a; Halgren, 1996b; Halgren, 1996c; Halgren, 1996d; Halgren, 1999a; Halgren, 1999b; Halgren & Nachbar, 1996) Drug Design: Screening of tens of thousands of compounds based on pharamcophoric models or “interactions...
理论化学分子力场分子力学MMFF力场分子模拟经验模型 MMFFVI.MMFF94sOptionforEnergyMinimizationStudiesTHOMASA.HALGRENMolecularSystemsDepartment,MerckResearchLaboratories,P.O.Box2000,Rahway,NewJersey07065Received13May1998;accepted16December1998ABSTRACT:ThisarticledescribesthederivationofMMFF94s,whichistheŽ.‘‘s’...
其中聚合物的拓扑结构与原子电荷由sobtop并调用MMFF94力场快速生成,CO2用的EPM2模型 ...
想用MMFF力场模拟低共熔溶剂,在SwissParam上上传了mol2文件,之后只有itp文件,拓扑文件里没有如下图(...