MM-PBSA计算得到的结果包含了熵,这个熵主要是构象熵。不过我不太明白,计算的构象熵到底是什么概念?
我对残基分解能量这部分一直有疑问,为什么得到的_pid~res_MMPBSA.dat文件中还有配体MOL的能量,不应该...
gmx_MMPBSA 手冊有哦 https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/dev/output/ 最上面那...
|MMPBSA.py Version=14.0 |Solvated complex topology file: ../model2_solvated.prmtop |Complex ...
MM-PBSA计算得到的结果包含了熵,这个熵主要是构象熵。不过我不太明白,计算的构象熵到底是什么概念?
当运行gromacs的时候,对象是蛋白蛋白复合物,目的是进行gmx_MMPBSA计算自由能,输入gmx pdb2gmx -f md...
复合和反应完全是两码事,不要乱用词。MMPBSA没法用来考察能否反应 ∆GSOLV仅仅体现溶剂效应对结合自由...