分享一下MLST的方法啦, 视频播放量 7313、弹幕量 5、点赞数 70、投硬币枚数 29、收藏人数 205、转发人数 56, 视频作者 MLCanytime, 作者简介 无情搬砖工具人,相关视频:PHYLOViz Online绘制MLST最小生成树,这兄妹的基因太强大了~!,749局基因融合实验 评论区为新物种赋名
MLST数据库可以轻松设置，例如大肠杆菌、肠炎沙门氏菌、肺炎克雷伯菌、弯曲杆菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌或可从在线存储库（例如mlst.net或pubmlst.org网站）获得的任何其他生物，只需从列表中选择生物即可。BioNumerics可以在本地下载等位基因，剪切位置和MLST类型，并在启动时更新其数据库，或从Web服务获取每次...
细菌MLST聚类分析方法 MLST聚类分析操作步骤 1
基因序列分析:从MLST database(http://pubmlst.org/abaumannii)下载猪链球菌的7个等位基因和已有的ST类型,利用blast将基因组和7个等位基因进行比对,根据最佳比对的结果获得每个样品中7个等位基因的序列类型,与已有的ST信息进行比较后自动...
多位点序列分析(MLST)分析 多位点序列分型的原理:MLST方法一般测定6~10个管家基因内部400~600bp的核苷酸序列,每个位点的序列根据其发现的时间顺序赋予一个等位基因编号,每一株菌的等位基因编号按照指定的顺序排列就是它的等位基因谱,也就是这株菌的序列型(sequence type,ST)。这样得到的每个ST均代表一组单独的核苷...
利用MLST分析结果,本文从系统发育树中的随机选择5株亲缘关系较远的凝结芽孢杆菌分离株评价了其对便秘小鼠的缓解作用。如图3所示,5株凝结芽孢杆菌处理组小肠推进率均显著高于模型组(P<0.05),其中B.C-39组最高(72.12%),B.C-10组最低...
多位点序列分析( 多位点序列分型(MLST)是一种分子分型技术,通过该技术,通常会对部分精心挑选的管家基因(位点)进行测序。 在典型的MLST方法中,重组的发生频率要比点突变高得多。因此,人们不会研究菌株之间的总的序列相似性。相反,而去筛选给定位点的每个序列与该位点的已知序列的相似性。如果序列不同,则将其视为...
MLST聚类分析操作步骤 1 •MLST是对细菌基因组的7个管家基因进行测序、比对,获得各个管家 基因的序列编号,最后根据7个基因的序列编号组成的编号阵列获得每 株菌的MLST型别、构建聚类树。(本方案以7个管家基因为例,但是 也有菌种的MLST分型方案不是7个管家基因的。分析方法相同。) •本方案描述了获得各个管家基...
多位点序列分析(MLST)分析 多位点序列分型的原理:MLST方法一般测定6~10个管家基因内部400~600bp的核苷酸序列,每个位点的序列根据其发现的时间顺序赋予一个等位基因编号,每一株菌的等位基因编号按照指定的顺序排列就是它的等位基因谱,也就是这株菌的序列型(sequencetype,ST)。这样得到的每个ST均代表一组单独的核苷酸...
2.3.2 MLST的分析结果 2.3.2.1 等位基因电泳及测序 选取7 个等位基因,运用设计好的等位基因引物对长双歧杆菌等位基因扩增。10 株长双歧杆菌的7 个等位基因均扩增成功,且有明亮单一条带,满足测序要求送样品进行测序。 2.3.2.2 长双歧杆菌的等位基因分型 ...