miRWalk是一个综合性的miRNA靶基因数据库,收录了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,和mirDIP类似,也是一个整合型数据库,整合了来自miRDB, TargetScan, miRTarBase等数据库中的信息,网址如下 http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/ 该数据库中共包含以下5个物种的miRNA靶基因信息 human mouse rat dog cow 官网提...
miRWalk:microRNA综合数据库 miRWalk数据库是一个集miRNA查询、miRNA靶基因及pathway查询于一体的在线、免费数据库。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和鱼6物种。 l miRNA查询 首先选择要查询物种,然后输入miRNA名称(注意名称中使用“-”而非下划线),可以获取miRNA序列及靶基因列表...
数据库官网地址为www.mirwalk.umm.uni-heidelberg.de,进入后点击右上角“Login”注册新账户,学术机构用户可申请教育邮箱认证获得高级权限。首次登录建议阅读导航栏“Tutorial”栏目的视频教程,特别注意数据上传格式要求与结果解读规范。 基因ID转换模块位于工具集第三栏,支持输入格式包括GeneSymbol、EnsemblID及RefSeq编号。
miRWalk数据库是一个功能全面的miRNA靶基因预测和验证工具，覆盖了人类、小鼠、大鼠、狗和牛等多种物种的基因信息。该数据库汇集了来自12个预测程序的miRNA结合位点信息，如DIANA-microTv4.0、DIANA-microT-CDS、miRanda-rel2010等，且定期更新，最新版本为V3。miRWalk支持双向预测模式，用户可以根据miRNA或...
mirwalk数据库的score值mirwalk数据库的score值 mirwalk数据库作为miRNA研究领域的重要工具,其score值设计直接影响研究者对靶基因预测结果的信任度。这个数值背后的生成逻辑,值得用放大镜观察。 从技术原理看,score值通常反映多个预测算法的一致性程度。当八个算法中有五个支持某个miRNA与mRNA的相互作用,score可能标记为...
小伙伴们平时肯定接触过miRNA预测吧,miRNA预测的有很多数据库,小果比较常用的就是TargetScan和miRDB,这些数据库的预测结果都不太一样,所以小果想要得到靠谱的结果就要综合这些结果,那有没有综合这些数据库的数据库呢?其实是有的,那就是数据库miRWalk 先上链接 ...
miRWalk2.0数据库介绍 miRWalk2.0是miRWalk数据库的改进版本。miRWalk2.0可以提供最全面的预测和实验验证的miRNA-mRNA相互作用,可以极大地帮助研究者对miRNA进行研究。miRWalk2.0不仅记录了基因完整序列中的miRNA结合位点,还可以将这些信息与12个现有miRNA-...
miRWalk(http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/)是一个综合性的miRNA靶基因数据库,收录了Human、Mouse、Rat、Dog、cow等多个物种的miRNA靶基因信息,不仅仅记录了基因全长序列上的miRNA结合位点,也会将其与已有的12个miRNA靶标预测程序(DIANA-microTv4.0 , DIANA-microT-CDS ,miRanda-rel2010 ,mirBridge, miRDB...
miRWalk，这个生物信息学界的明珠，http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/，是您寻找miRNA靶基因的全方位伙伴。它汇集了人、鼠、大鼠、犬、牛等多个物种的详尽信息，囊括了基因全长序列上的miRNA结合位点，并与12种权威预测工具（DIANA-microTv4.0、miRanda-rel2010等）的结果进行整合，确保了预测...
miRWalk2.0不仅仅记录了基因全长序列上的miRNA结合位点,也会将其与已有的12个miRNA靶标预测程序(DIANA-microTv4.0 , DIANA-microT-CDS , miRanda-rel2010 , mirBridge , miRDB4.0 , miRmap , miRNAMap, doRiNA i.e.,PicTar2, PITA RNA22v2 , RNAhybrid2.1 and Targetscan6.2 )的预测结合信息集合进行结合关联...