此外,作者对miRNA-mRNA的配对最初是基于miRNA和mRNA的表达值之间的相关性,然后在用miRanda等进行靶向预测。但是实际上,通过miWALK可以发现更多的潜在靶标,miWALK是目前常用的miRNA靶标预测手段(PMID:21605702),它是基于miRAN与mRNAde 3’-UTR区域的结合情况进行预测,因此其分析结果也更加可靠,将这些潜在靶标与差异mRNA...
mRNA和miRNA联合分析 GEO数据的分析GEO登录号：GSE16759 mRNA结果分析 mRNA结果 miRNA结果分析 miRNA结果 miRNA筛选 2-2 mRNA筛选 1-1 批量预测miRNA靶基因http://diana.imis.athena-innovation.gr/ 网页：http://diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=microT_CDS/index GPL8757 miRbasehttp:/...
3:证实miRNA在某位点切割靶基因的Degradome-Seq实验数量。 4:表示在实验中观察到的特定miRNA与其靶mRNA相互作用的样本总量。 5:miRNA介导的切割事件的分类,由starscan程序评估。 6:根据研究目的输入关键词搜索。 点击“CleaveEventNum”列中的数字可查看miRNA切割位点,如下图所示。结果中“P-value”为不同物种的同源...
The experimentally verified miRNA-mRNA pairs were downloaded from starBase v3.0 (18), DIANA-Tarbase v8 (19), miRTarbase (v7.0) (20) and miRSponge (21) databases, while the experimentally validated miRNA-lncRNA pairs were extracted from starBase v3.0 (18), LncACTdb2.0 (22), DIANA-LncBase Exp...
目的 卵巢癌是妇产科恶性肿瘤死亡的主要原因之一,但其致病分子机制还未被清晰阐明.该研究通过整合生物信息学方法,旨在挖掘其潜在的关键基因分子及生物学功能,以便更全面地揭示其发病机制.方法 从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载miRNA和mRNA表达谱芯片集.通过R语言"limma"包筛选差异表达的miRNA和mRNA.通过FunRich...
需要金币:*** 金币(10金币=人民币1元) 常用的数据库操作演示2mrna和mirna联合分析及network绘制.pptx 关闭预览 想预览更多内容,点击免费在线预览全文 免费在线预览全文 出发的研究 DianaTools/index.php?r=microT_CDS/index :/// 感谢您的观看 下载文档 ...
STRING数据库构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络,对前20个枢纽基因进行表达验证和生存分析.结果对375例HCC样本,50例癌旁样本进行差异miRNA分析,共鉴定出300个差异表达的miRNA.对374例HCC样本,50例癌旁样本进行差异mRNA分析,共鉴定出1106个差异表达的mRNA.分别在上调的和下调的miRNA中选择20个差异表达最显著的miRNA预测...
1.基于生物信息学方法构建类风湿性关节炎miRNA-mRNA调控网络2.基于GEO数据库整合miRNA-mRNA表达谱筛选卵巢癌的关键基因分子及生物信息分析3.基于TCGA和GEO数据库构建胃癌ceRNA调控网络4.基于GEO数据库的卵巢癌ceRNA调控网络构建及相关lncRNAs的筛选5.基于生物信息学方法构建重度抑郁症发病的miRNA-mRNA调控网络 因版权原因,...
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百度试题 题目TCGA 数据库主要收录各种人类癌症的数据类型有 A.临床数据B.基因组变异数据C.mRNA表达数据D.miRNA表达数据相关知识点: 试题来源: 解析 A,B,C,D 反馈 收藏