关联分析miRNA与mRNA互作关系研究是构建骨骼肌发育调控网络的基础.研究利用北京鸭胚胎期不同孵化时间胸肌组织的差异miRNA和mRNA数据进行miRNA和mRNA的关联分析.结果显示:①E13-E19间有43个miRNA和22个mRNA关联到一起,E27-E19间有48个miRNA和141个mRNA关联到一起;②E27-E19间关联到基因的GO条目主要与肌肉发育相关,...
lncRNA 通过与miRNA 竞争结合靶基因mRNA 的3'-UTR,间接抑制miRNA 对靶基因的负向调控;2) 某些lncRNA 通过细胞内的剪切作用可形成miRNA 的前体,进而加工生成特异miRNA,调控靶基因的表达进而发挥功能;3) 个别lncRNA 可发挥内源性miRNA 海绵的功能,抑制miRNA的表达。因此,整合分析miRNA-lncRNA-mRNA之间的调控关系...
据此,miRNA的表达水平应与其靶mRNA的表达水平相反,利用这一调节机制我们将转录组差异基因库和miRNA测序获得的差异的靶基因库做交集,找出两库重合基因,然后根据上调miRNA得到下调差异靶基因,下调miRNA得到上调差异靶基因。关联分析结果表明,中国地鼠口腔颊囊黏膜鳞癌组织与正常组织中显著差异表达的11个 miRNA 中有8个关联到...
基于转录组测序技术进行静原鸡差异miRNA与mRNA的关联分析
结果成功构建中国地鼠口腔颊黏膜癌中差异表达的miRNA和mRNA表达谱,共发现11个已知miRNA,3个新miRNA显著性差异表达和194个mRNA差异表达,且一个miRNA可调控多个mRNA,多个miRNA靶向调控某个mRNA.结论本实验OSCC中差异表达的miRNA通过调控mRNA形成复杂的调控网络,在口腔癌的发生发展中发挥重要作用,为口腔癌的发生,发病机制,...
鸭骨骼肌关联分析miRNA与mRNA互作关系研究是构建骨骼肌发育调控网络的基础.研究利用北京鸭胚胎期不同孵化时间胸肌组织的差异miRNA和mRNA数据进行miRNA和mRNA的关联分析.结果显示:①E13-E19间有43个miRNA和22个mRNA关联到一起,E27-E19间有48个miRNA和141个mRNA关联到一起;②E27-E19间关联到基因的GO条目主要与肌肉发...
对miRNA和其靶向调节的mRNA进行关联分析,共关联到1 770个miRNA-mRNA对为负调控关系,其中涉及到274个差异的miRNA和603个差异的mRNA.显著差异表达的miRNA靶基因被注释到了1 430条GO terms和327条KEGG pathway,富集到FoxO信号通路(FoxO signaling pathway),mTOR信号通路(mTOR signaling pathway)...
因此,整合分析miRNA-lncRNA-mRNA之间的调控关系能够更全面的阐述疾病的发生和发展。 2技术路线及方法: 实验验证 Real-time PCR验证差异表达的miRNA, lncRNA和mRNA。 双荧光素酶报告基因验证miRNA与其靶基因的相互作用 样本要求:每组样本不少3个。 mRNA测序:RNA样品总量: ≥1.5 μg;RNA样品浓度: ≥50 ng/μL...
miRNA富集分析为探究静原鸡肌肉组织肌苷酸沉积过程的分子调控机制,本研究以静原鸡胸肌和腿肌组织作为试验材料,通过转录组测序技术,利用生物信息学分析方法筛选出差异表达miRNA及其靶基因.分析结果表明,静原鸡胸肌和腿肌组织的比较组合中有39个差异表达miRNAs (19个显著上调, 20个显著下调).通过miRNA-mRNA互作网络分析可知,...