miRNA数据库是指存储和管理miRNA数据的在线资源。miRNA(microRNA)是一类非编码RNA分子,它们在基因表达调控中起着重要的作用。miRNA数据库为研究者提供了一个方便的平台,可以查询和获取关于miRNA的基本信息、序列、表达模式以及与疾病相关的信息。 有哪些知名的mirna数据库? miRBase: miRBase是目前最广泛使用的miRNA数据...
miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA 序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。 4.miRecords mirecords.biolead.org/动物miRNA 的靶相互作用的数据库, 包括人工收集...
RNAcentral是由EBI开发的一个非编码RNA数据库,整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多个数据库中的非编码RNA信息,旨在为ncRNA的研究提供一个统一的参照,网址如下 https://rnacentral.org/ 目前最新版本为v10, 整合了来自miRBase v22和LNCipedia 5.0版本的最新数据,同时新增了reads mapping和GO 注释,...
miRBase数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。该数据库于2014年6月更新为最新版本V21.0,包含223个物种的35828个成熟的miRNA序列。该数据库提供便捷的网上查询服...
miRNEST是一个整合了动物,植物和病毒microRNA数据的综合数据库,这是一个集成的microRNAs资源。该数据库由波兰Adam Mickiewicz大学 Izabela Makałowska的基因组进化实验室建立,数据库的核心部分是作者根据225种动物和202种植物的表达序列标签(EST)进行的miRNA预测。 另外,miRNEST的外部miRNA数据已经被并入13个数据库中...
miRBase: miRBase是一个广泛使用的miRNA数据库,提供了miRNA序列、注释、家族分类和功能预测等信息。可以通过miRBase获得miRNA的基本信息,如序列、长度、表达模式等。 TargetScan: TargetScan是一个广泛使用的miRNA靶点预测数据库,可以帮助研究人员确定miRNA与其靶基因之间的相互作用关系。通过TargetScan可以预测miRNA靶基因,并...
miRNA数据库篇——MISIM:mircoRNA功能相似性数据库 MISIM:mircoRNA 功能相似性查询数据库MISIM是一个可以用来预测miRNA之间功能相似性的数据库。http://www.lirmed.com/misim/Home如上图所示...意义上的富集分析是不一样的。一个是富集分析输入的miRNA和哪些miRNA有关。另外一个是富集分析输入的miRNA和哪些疾病...
miRex是一个分析microRNA基因表达的在线资源库,搜集,整理和分析已发表的关于microRNA基因表达的数据,它允许研究者通过数千数据点来分析基因表达和提供microRNA基因表达数据的在线保存。 16.PolymiRTS http://compbio.uthsc.edu/miRSNP/ 自然产生的miRNA的靶标位点DNA变异的数据库. ...
一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间:2013年11月。
miRTarBase作为一个miRNA-靶标互作的数据库，前后经历了五次修改和增强。2022年更新版的数据库可访问地址：https://miRTarBase.cuhk.edu.cn/。更新版数据库包括从13389篇文章和 CLIP-seq 数据中积累的220万个经实验验证的MTI。采用优化的评分系统，增强本次更新对 MTI 相关文章和相应疾病信息的识别。整合了胞外囊...