提取每个Sbi-miR396家族基因的物理位置,并在TBtools软件中使用GTF/GFF的基因位置可视化构建染色体定位图,Sbi-miR396前体的二级茎环结构使用RNAfold预测,采用具有基本选项的折叠算法来选择最小自由能和分配函数。使用具有默认参数值的psRNATarget预测Sbi-miR396的...
近年来研究表明,miR396可以参与植物生长发育、生物及非生物胁迫响应等过程[5-8]。miR396的靶基因包括生长调节因子(growth-regulating factor,GRF)、基本螺旋-环-螺旋转录因子(basic Helix-Loop-Helix 74,bHLH74)、短营养期相关基因(short vegetative phase,SVP)、GRAS(含有GRAS结构域)家族基因成员(...
而VvGRF1呈现相反表达模式; 在有核品种‘魏可'种子发育中,VvmiR396表达量呈下降趋势,在花后42 d表达量最低,靶基因的表达模式相反,表明VvmiR396可能介导VvGRF1正调控葡萄种子败育,而负调控种子的发育。