https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main/mimic-iv/concepts_postgres 大家如果无法访问官方网站,可以后台回复“物化视图”,就可获取物化视图脚本。 物化视图需要2个官方提供的sql文件 ,如下如图所示,生成函数sql 和生成视图sql,如果大家没有这两个文件请后台私信【生成函数】 首先我们打开,postgresSQL运行窗...
mimic-iv数据库官方的视图安装脚本可以在官方网站下载，官方地址为：https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main/mimic-iv/concepts_postgres 大家如果无法访问官方网站，可以后台回复“物化视图”，就可获取物化视图脚本。物化视图需要2个官方提供的sql文件 ，如下如图所示，生成函数sql 和生成视图sql，如果大家...
首次登陆到psql后,默认进入的是postgres数据库,我们需要切换到mimiciv数据库,执行\c mimiciv命令切换到mimiciv数据库 切换到mimiciv数据库后,找到你的postgres-functions.sql代码所在的目录,然后使用\i 命令执行这份代码,比如,笔者的代码存放在C:\BaiduNetdiskDownload\mimic-code-main\mimic-iv\concepts_postgres,则执行...
MIMIC Code Repository: Code shared by the research community for the MIMIC family of databases - mimic-iv/concepts_postgres/postgres-functions: remove obsolete `mimic… · MIT-LCP/mimic-code@03107d4
1.参考前面数据安装步骤，打开命令界面，进入mimiciv数据库，配置数据库函数 2.运行shell脚本生成衍生表格数据文件夹postgres(windows运行shell脚本可通过安装git运行,可自行百度安装)。3.衍生表格数据。4.修改postgres-make-concepts.sql文件。5.运行postgres-make-concepts.sql文件（注意替换为自己的文件路径）运行时间有...
进入默认数据库后,我们输入命令切换mimic数据库,输入【\c mimiciv】 可以看到已经进入了mimiciv数据库,接下来我们继续物化视图,找到刚刚官方提供的两个sql,首先执行第一个sql,postgres-funcitons,找到该sql后用\i 去执行。输入命令: \i C:/Users/Administrator/Desktop/mimic-code-main/mimic-iv/concepts_postgres/...
This folder contains scripts to generate useful abstractions of raw MIMIC-IV data ("concepts"). 4+ The scripts are written using the**BigQuery Standard SQL Dialect**. Concepts are categorized into folders if possible, otherwise they remain in the top-level directory. The[postgres](/mimic-iv/...
执行以下操作，导入数据：将解压脚本放置在指定目录，并通过SQL Shell连接PostgreSQL，以postgres用户，密码连接，创建mimiciv数据库。在PostgreSQL bin目录，执行如下命令（记得替换路径和脚本文件名）：```shell"C:\Program Files\PostgreSQL\15\bin\psql.exe" -U postgres -p 5432 -d mimic4 -v ON_...
之前以MIMIC-III为主,现在mimic-iii和mimic-iv合并在一起了 mimic数据库为了让研究者访问更加方便,很大一个改变是部署在云上比如google的云平台,云平台上需要big query语法来访问,所以现在代码库关于数据提取的代码更新以big query为主,需要通过脚本转化为适合postgres语法 ...
代码来自https://github.com/MIT-LCP/mimic-iv/concepts_postgres。此外,在患者住院后立即测量生命体征,包括收缩压、舒张压、心率和氧饱和度(SpO2)。记录以下SA-AKI共病:高血压、糖尿病和心脏手术。随后,提取入院第一天内的实验室指标,包括血红蛋白、白细胞、血小板、葡萄糖、凝血酶原时间和尿量。计算ICU入院时的...