miTED 为每个输入 miRNA 提供指向 DIANA-microT-CDS ( 31 ) 的超链接,这是一个预测 miRNA 目标的网络服务器,DIANA-Tarbase v.8 ( 32 ) 一个实验支持的 miRNA 目标的参考数据库,DIANA-LncBase v.3 ( 33),一个参考存储库,在长非编码 RNA 上具有实验支持的 miRNA 靶标,以及 DIANA-miRPath v.3(34),一...
MicroRNA(以下简写为miRNA)作为临床和科研领域的明星分子,一直以来都备受研究者的青睐。我们都知道,成熟的miRNA其结构上5’端是一个磷酸基团,3’端则是羟基基团,其本身是一类非编码的短序列小RNA,miRNA发挥作用主要依赖于其对靶基因的调控。那么接下来小编就为看官们从各类网站汇总了一些常用的miRNA靶基因数据库,知...
PMRD是一个关于植物microRNA数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于植物microRNA的数据。中国北京中国农业大学 CoGeMiR:http://cogemir.tigem.it/ CoGeMiR数据库总结关于在进化过程中microRNA在不同动物中的保守性。该数据库搜集已知的和预测的mi...
?生物信息学)microRNA相关数据库简介 关于microRNA miRNA，一种广泛存在于真核生物中的内源性单链小分子RNA(~22nt)，特异性抑制基因翻译;1993年，Lee等在秀丽新小杆线虫中发现第一个可时序调控胚胎后期发育的miRNAlin-4；2002年，Reinhart等又在线虫中发现第二个异时性开关miRNA家族let-7;现有发现已证明miRNA在...
miRWalk数据库是一个集miRNA查询、miRNA靶基因及pathway查询于一体的在线、免费数据库。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和鱼6物种。 lmiRNA查询 首先选择要查询物种,然后输入miRNA名称(注意名称中使用“-”而非下划线),可以获取miRNA序列及靶基因列表。miRWalk中靶基因列表可以点击“Export”输出为csv格式文件。
miRWalk数据库是一个集miRNA查询、miRNA靶基因及pathway查询于一体的在线、免费数据库。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和鱼6物种。 l miRNA查询 首先选择要查询物种,然后输入miRNA名称(注意名称中使用“-”而非下划线),可以获取miRNA序列及靶基因列表。miRWalk中靶基因列表可以点...
在生物医学研究领域,准确且全面的microRNA组织表达数据对于理解生物过程、疾病机制以及药物开发至关重要。近日,我发现了DIANA-mitED这一新的microRNA组织表达数据库,它为研究者提供了一个全新的视角来探索这一关键领域。DIANA-mitED数据库涵盖了广泛的组织类型,包括199个组织样本,这些样本覆盖了人体各个系统和器官,为研...
microRNA数据库一网打尽 microRNA数据库⼀⽹打尽 miRNA⾃从被发现以来，⼀直备受关注，俨然已成为⾮编码RNA家庭中永不凋零的“玫瑰”。关于miRNA，主要有两个研究⽅向，其⼀是作为biomarker，这⽅⾯研究仅需⾜够庞⼤的临床样本⽀撑即可；miRNA的另⼀研究⽅向为功能机制研究，此时必须有miRNA...
一个全新的MicroRNA-Pathway数据库 聊聊跟科研有关的感想心得,如基金,文章和实验。 有小伙伴在后台力求介绍miRNA的经典研究套路。 周五了,还这么努力 好吧,在我们聊miRNA套路之前,梦熊先安利一款miRNA/pathway研究的数据库:miRPathDB 该数据的主要功能是查询参与通路内调控的miRNAs,包含了人、鼠两类数据。 主要有三类...
[关键词]数据库;microRNA;靶基因;PMTED;miRGen2.0;TarBase6.0;miRFANs [中图分类号]Q811.4[文献标识码]A[文章编号]1009-0002(2014)05-0746-07 IntroductionofFourmicroRNATargetGeneDatabases HEJun-Hua,GAOYa-Mei,HANYi-Qiang*,ZHANGZheng-Lai,ZHANGFang-Liang ...