mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种领先方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高,通过代谢组与基因组整合的mGWAS分析,可以得到精准的代谢物的调控基因信息, 促进个性化疾病预防和复杂疾病治疗的发展,解析代谢遗...
2025年3月1日,北京市农林科学院玉米所赵久然研究员团队在Molecular Plant期刊在线发表了题为 “Large-scale metabolomic landscape of edible maize reveals convergent changes in metabolite differentiation and facilitates its breeding improvement”的研究论文。本研究对452份玉米种质资源进行mGWAS研究,通过分析鲜食玉米...
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种领先方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高,通过代谢组与基因组整合的mGWAS分析,可以得到精准的代谢物的调控基因信息,解析代谢遗传机制。 应用领域 植物功能基因发掘 植物...
将GWAS与微生物群落进行关联分析即mGWAS(microbiome Genome-Wide Association Study)。mGWAS是以微生物群落的数据作为表型,与基因组SNP数据进行关联分析,帮助人们更好地理解宿主和微生物以及表型性状之间的相互作用,以及遗传因素对微生物群落的影响。微生物组全基因组关联研究(mGWAS)已经用于阐明宿主遗传变异与人类肠 道...
mGWAS主要应用策略: 1. 标准mGWAS分析可鉴定影响果蔬风味、农作物营养价值、药用植物活性成分等相关的候选基因和调控机制 2. 关注表型的代谢物生物学标记及相关调控基因,可选择: 1)GWAS与mGWAS联合分析; 2)代谢物先与表型进行关联分析,明确目的性状相关的代谢物质,有效缩小候选代谢物的范围,之后再进行mGWAS分析。
mGWAS是什么？mGWAS详细介绍 mGWAS是什么？mGWAS详细介绍mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)是将代谢组数据作为表型，与基因型数据进行关联分析的一种领先方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细，因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高，通过代谢组与基因组整合的mGWAS分析，可以得到精准的代谢物的调控...
宿主基因组微生物关联的新思路主要包括以下几点：关注微生物群落：mGWAS将焦点从传统GWAS的基因型与复杂性状关系，转向微生物群落的组成和丰度。以微生物群落的特征作为表型，与宿主基因组SNP数据进行关联分析。揭示基因与微生物共同塑造宿主表型：mGWAS提供了一种新视角，揭示基因与微生物群落如何相互作用，...
1.自然群体若有分群,做代谢物差异分析,mGWAS寻找位点,重点关注控制差异代谢物的位点。 2.基因克隆,找到变异调控代谢物的机理。 3.位点比较,进行演化和群体遗传研究。 4.研究代谢物如何影响表型变化(如通路水平)。 请注意,mGWAS实验方法的具体实施可能因研究目的、样本来源和实验条件等因素而有所不同。在实验设计和...
代谢全基因组关联研究(mGWAS)显示,在3号染色体()上发现了一个包含6个基因的脂肪酸代谢基因簇的主要位点,该基因簇控制角质单体羟基单酰基甘油(HMGs)的含量和水稻产量,可能是通过成员转录的变化来实现的。研究发现HMG在内质网中依次由合成,随后由和转运到外质体。FGC3成员突变导致HMG减少,致使雄性生殖发育缺陷和产量...
通过mGWAS，我们可以发现控制代谢物合成和调控的关键基因。例如，某些代谢物的积累水平与宿主基因型直接相关，表明代谢组也受到宿主遗传调控，从而为改良作物的品质、提高产量和抗逆性提供理论依据。与传统的基因组关联研究相比，mGWAS能够更准确地揭示基因型与表型之间的关联，为作物遗传改良提供更可靠的指导。因此，在当前...