(1)整体把握m6A甲基化图谱特征:m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析 (2)筛选具体差异m6A peak和基因:差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修...
m6A 是一种动态且可逆的修饰,由定义为“写入器”的蛋白质沉积并被“擦除器”蛋白质去除。第三个表观转录组蛋白家族(“阅读器”)可识别甲基化 RNA,从而导致转录本的剪接、核输出、翻译、稳定性改变和降解。通过这种方式因此,m6A 修饰可以介导 特定基因RNA 的表达或...
关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术 易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应...
近日,美国得克萨斯大学西南医学中心Yunsun Nam团队揭示了癌症相关突变如何通过改变METTL3-METTL14复合体对RNA甲基化(m6A)的特异性来促进肿瘤发生。研究发现,METTL14的R298P突变能够改变m6A的序列偏好,优先修饰含有GGAU motif的非典型位点,导致非典型m6A修饰位点累积,激活促癌通路(如WNT信号),从而促进细胞迁移、侵袭和肿...
本研究探讨了Hippo通路中m6A甲基化对乳腺癌细胞增殖和代谢的调控机制。我们通过Hippo通路因子LATS1证明m6A调控在乳腺癌的增殖和糖酵解代谢中发挥重要作用。METTL3被鉴定为m6A的writer,YTHDF2被鉴定为LATS1 mRNA的阅读蛋白,在乳腺癌的肿瘤发...
研究人员建立了 HFD 小鼠模型,通过 m6A dot blot 检测发现 HFD 小鼠肝脏中的 m6A 水平比正常小鼠高,这表明 m6A 甲基化可能参与了 NAFLD 的进展。进一步检测 m6A 相关酶的表达,发现只有 METTL3 的水平在 HFD 小鼠肝脏中显著增加,而且在 NAFLD 和 NASH(非酒精性脂肪性肝炎)患者的血清中,METTL3 的表达也有所...
高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; 重复性高:IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差; ...
RNA修饰是一种重要的表观遗传调控机制,RNA N6-甲基腺苷(m6A)是人类最丰富的RNA修饰类型,在mRNA剪接、翻译和降解的转录后调控中起关键作用。在许多癌症类型中,m6A调节酶的异常表达与肿瘤发生、转移、耐药性和癌症干细胞自我更新有关。m6A调控因子METTL3是前列腺癌(PCa)多种进展过程中的重要调控基因。已有报道称METTL...
2023年11月,南方科技大学/暨南大学深圳市人民医院陈善泽团队在Cell & Bioscience杂志上发表学术论文“METTL3-mediated m6A methylation regulates ovarian cancer progression by recruiting myeloid-derived suppressor cells”,为METTL3介导的m6A甲基化提供了新的见解,即调节宿主针对卵巢癌的免疫反应。
N6-甲基腺嘌呤(m6A)METTL3疾病N^(6)-甲基腺嘌呤(N^(6)-methyladenosine),即m^(6)A修饰,普遍存在于各种真核生物中,是真核细胞RNA中最常见的甲基化修饰,占所有RNA甲基化修饰的80%以上.METTL3作为m;A甲基转移酶复合体的核心催化亚基,可以修饰多种承担重要功能分子的转录本,并由此参与细胞的分化,增殖和发育等...