富集方法越来越多,当时我们千篇一律就是DAVID,但是更新速度慢被广为诟病,越来越多的富集方法例如clusterprofiler,gProfiler,enrichR等被开发了出来,越来越方便,也越来越容易。如果非要选择一款又高大上又简单快捷软件,那么我推荐Metascape。Metascape于2019年发表在Nature communication上,已被引用超过5800次。操作简单,结果...
从数据库种类来说,Metascape整合了GO、KEGG、UniProt和DrugBank等多个权威的数据资源,使其不仅能完成通路富集和生物过程注释,还能做基因相关的蛋白质网络分析和涉及到的药物分析,致力于为科研工作者提供每个基因全面而详细的信息。 从所支持的物种数量来说,Metascape不仅能处理人类物种的基因,还能处理包含动物、植物、真菌...
第一个Metascape应用程序于2015年12月9日发布。Metascape从那时起经历了多次发布。它目前支持常见的模式生物的富集分析,蛋白质 - 蛋白质相互作用网络,其结果可以自动呈现为科满足科研杂志要求的形式,同时可以输出为Excel和PowerPoint演示文稿满足科研交流。Metascapehttp://metascape.org/gp/index.html#/main/step1 分析...
1 metascape 介绍 http://metascape.org metascape 是属于目前来说最良好的数据分析网站,他可以满足使用者目前最主流的生物信息学分析流程,例如 KEGG 通路富集、GO 功能注释、PPI 网络等。并且最重要的是画出来的图形极其的美观,几乎不需要任何的后期修饰,而且在 nature、cell 这样的大期刊发表的很多文章中的图片也是...
Meta分析系统教程(协助安装5款Meta软件) 3670 已完结 ·共90课时 长期有效 课程专注科研Meta分析,由浅入深,从统计小白到Meta大神发布者 关注 陈老师spss数据分析 从事数据分析行业10余年,B站课堂讲师、丁香园公开课特邀讲师、B站粉丝40W+、公众号及其他自媒体粉丝70W+,指导学员10000+ 课程概述 评论(2) 常见问题 Q...
打开Metascape的主页(http://),页面左侧最明显的一块就是进行Express Analysis的区域 提交基因的时候,可以选择从本地文件上传gene list,如果需要分析的基因数目较少,也可以直接在输入框中粘贴基因。 这一步需要注意的友情小tip:要留心所支持的文件格式与表示基因的方式。Metascape支持3种gene list提交格式,分别是Excel...
打开Metascape的主页(http://metascape.org),页面左侧最明显的一块就是进行Express Analysis的区域 提交基因的时候,可以选择从本地文件上传gene list,如果需要分析的基因数目较少,也可以直接在输入框中粘贴基因。 这一步需要注意的友情小tip:要留心所支持的文件格式与表示基因的方式。Metascape支持3种gene list提交格式...