上述反应结束后,从60℃～95℃过程中进行熔解曲线分析 5.实验结果 qPCR检测结果(详细数据见附件excel” M6A-meRIP数据分析结果”) Merip-qPCR柱状图: meRIP-阳性质控柱状图 NC组meRIP-qPCR柱状图 Treat组meRIP-qPCR柱状图 Merip RNA 片段化图: Merip RNA 片段化图...
顾名思义,MeRIP-qPCR就是MeRIP实验后进行的qPCR实验。这里的MeRIP实验同MeRIP-seq测序中MeRIP实验相同,实验基本操作也一致:对RNA进行片段化,然后将片段化后的RNA样品分为二部分:一部分用于免疫共沉淀实验(IP)后作为IP样品,另一部分不进行IP直接作为Input样品。之后再根据实验目的的不同,对两部分RNA片段进行逆转录和q...
部分课题组甚至会舍弃IgG,只有IP和Input,分别为1:1。 所以接下来我们就要详细讨论下m6A-IP-qPCR是如何计算相对表达量的。MeRIP-qPCR是m6A-IP-qPCR的另一种说法。所以从名称上我们就能发现,m6A-IP-qPCR基本和常规的RIP-qPCR相似。当然在讨论RIP-qPCR之前,我们先来看看常规的RT-qPCR是如何计算相对表达量的。 ---...
艾德科技---m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 【MeRIP试剂盒】(A-P-9018)-EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit/艾德科技---m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 【MeRIP试剂盒】(A-P-9018)-EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit//
另外,从结果的形式%(IP/Input)也可以看出,MeRIP-qPCR实验侧重看修饰的片段(IP样品qPCR结果)占总片段(Input样品qPCR结果)的比例,实验目的只是要得到这两者的比值就体现修饰水平,因此MeRIP-qPCR不需要内参。 例如:针对目的基因目的位点qPCR,样品A的IP结果0.2,Input结果1;样品B的IP结果0.3,Input结果1.5,得到的%(IP/In...
另外,从结果的形式%(IP/Input)也可以看出,MeRIP-qPCR实验侧重看修饰的片段(IP样品qPCR结果)占总片段(Input样品qPCR结果)的比例,实验目的只是要得到这两者的比值就体现修饰水平,因此MeRIP-qPCR不需要内参。 例如:针对目的基因目的位点qPCR,样品A的IP结果0.2,Input结果1;样品B的IP结果0.3,Input结果1.5,得到的%(IP/In...