图2. MeRIP-qPCR检测结果:Input%分析 图3. MeRIP-qPCR检测结果:Fold Enrichment分析 图4. MeRIP-qPCR检测结果:信噪比优于采用游离m6A洗脱的传统流程 图5. MeRIP-Seq结果展示:IGV可视化 图6. MeRIP-Seq结果展示:Motif分析 图7. MeRIP-Seq结果展示:m6A分布线图 图8. MeRIP-Seq结果展示:韦恩图 图9. MeRIP-Seq...
5.实验结果 qPCR检测结果(详细数据见附件excel” M6A-meRIP数据分析结果”) Merip-qPCR柱状图: meRIP-阳性质控柱状图 NC组meRIP-qPCR柱状图 Treat组meRIP-qPCR柱状图 Merip RNA 片段化图: Merip RNA 片段化图
qPCR实验检测NX和LW猪肌肉中与m6A相关基因的表达水平。代表性NX和LW猪背最长肌切片中FTO(绿色)图像;DAPI用于核染色(蓝色)。Western blotting实验结果表明,在LW猪肌肉中FTO表达水平升高,METTL4表达水平降低。使用ImageJ软件对m6A水平进行定量分析。Western blotting实验结果表明,在分化后第0、2和4天,猪卫星细胞(PSCs)...
得到的结果往往是一个%(IP/Input)的数值,它体现的是该位点的修饰水平(目标基因发生该修饰的转录本占该基因总转录本的比例),而普通qPCR验证的是某个基因的表达水平(共表达了多少转录本)。 2)MeRIP-qPCR的实验方法 MeRIP-qPCR就是MeRIP实验后进行一个qPCR。在RNA量充足的情况下,可以直接使用MeRIP后的产物分别进行...
MeRIP-seq实验流程图 1、MeRIP-qPCR的目的是什么? MeRIP-qPCR是验证某目标基因上的某个修饰位点(以一小段区域的形式,MeRIP法精确不到单碱基)的修饰水平。得到的结果往往是一个%(IP/Input)的数值,它体现的是该位点的修饰水平(可以理解为:这个转录本表达了很多条,其中这个位点有修饰的有多少条?)。与普通qPCR验证...
内参是衡量不同样品间表达量时用来均一化样品的,比如默认GAPDH在你的各个样本之间表达量应当相同,qPCR结果样品A中目的基因表达量1,GAPDH表达量10;样品B中目的基因表达量1.5,GAPDH表达量15,那么不能说因为1<1.5所以就说A样品目的基因表达量低,因为从GAPDH来看可能只是实验某环节中A样品的量整体少了一些而已。而是要...
实验流程 图1:m6A MeRIP试剂盒实验流程 结果展示 图2. MeRIP-qPCR检测结果:Input%分析 图3. MeRIP-qPCR检测结果:Fold Enrichment分析 图4. MeRIP-qPCR检测结果:信噪比优于采用游离m6A洗脱的传统流程 图5. MeRIP-Seq结果展示:IGV可视化 图6. MeRIP-Seq结果展示:Motif分析 图7. MeRIP-Seq结果展示:m6A分布线图 ...
结果图形 (1)LW和NX猪在肌肉发育新生仔猪阶段的差异 图1:5日龄NX猪和LW猪背最长肌特征。 (2)m6A修饰调控猪肌肉发育 图2:m6A修饰参与调控肌肉发育。 qPCR实验检测NX和LW猪肌肉中与m6A相关基因的表达水平。 代表性NX和LW猪背最长肌切片中FTO(绿色)图像;DAPI用于核染色(蓝色)。
(1)MeRIP-qPCR不需要内参来进行样本间的均一化矫正 从结果的形式%(IP/Input)我们也可以看到,这个实验侧重看修饰的片段(IP样品qPCR结果)占总片段(Input样品qPCR结果)的比例,实验目的只是要得到这两者的比值就体现修饰水平,因此MeRIP-qPCR不涉及到普通的相对定量qPCR...
3)MeRIP-qPCR为什么没有内参基因? MeRIP-qPCR不需要使用内参来进行样本间的对比,此实验主要是通过计算发生修饰的转录本(IP)占该基因总转录本(Input)的比例,来体现该位点的修饰水平。 4)IP/Input/IgG都需要展示? MeRIP-qPCR的结果用柱状图展示更为直观,文章中常用的有以下3种: ...