另外,从结果的形式%(IP/Input)也可以看出,MeRIP-qPCR实验侧重看修饰的片段(IP样品qPCR结果)占总片段(Input样品qPCR结果)的比例,实验目的只是要得到这两者的比值就体现修饰水平,因此MeRIP-qPCR不需要内参。 例如:针对目的基因目的位点qPCR,样品A的IP结果0.2,Input结果1;样品B的IP结果0.3,Input结果1.5,得到的%(IP/In...
5.实验结果 qPCR检测结果(详细数据见附件excel” M6A-meRIP数据分析结果”) Merip-qPCR柱状图: meRIP-阳性质控柱状图 NC组meRIP-qPCR柱状图 Treat组meRIP-qPCR柱状图 Merip RNA 片段化图: Merip RNA 片段化图 分子生物实验 甲基化 m6A
图4 MeRIP-seq实验流程 与普通的qPCR有所不同,MeRIP-qPCR是验证某个目标基因上的某个修饰位点(以一小段区域的形式,MeRIP法精确不到单碱基)的修饰水平。得到的结果往往是一个%(IP/Input)的数值,它体现的是该位点的修饰水平(目标基因发生该修饰的转录本占该基因总转录本的比例),而普通qPCR验证的是某个基因的表...
实验流程结束后，我们得到了Merip-qPCR柱状图和Merip RNA片段化图，以可视化的方式展示了实验结果。
我们先进行一个简单的计算,常规的RT-qPCR1个反应(1个复孔)需要的totalRNA至少0.1-1μg左右。我们按照最小反应起始量来算的话,那么1个反应需要至少100ng的totalRNA,3个技术重复(3个复孔),总计totalRNA为300ng。 我们知道totalRNA中绝大部分为rRNA,那么只有不到5%的RNA为我们需要研究的对象。PCR反应需要引物跟...
艾德科技---m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 【MeRIP试剂盒】(A-P-9018)-EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit/艾德科技---m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 【MeRIP试剂盒】(A-P-9018)-EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit//
MeRIP-seq实验流程图 1、MeRIP-qPCR的目的是什么? MeRIP-qPCR是验证某目标基因上的某个修饰位点(以一小段区域的形式,MeRIP法精确不到单碱基)的修饰水平。得到的结果往往是一个%(IP/Input)的数值,它体现的是该位点的修饰水平(可以理解为:这个转录本表达了很多条,其中这个位点有修饰的有多少条?)。与普通qPCR验证...
MeRIP-seq实验流程图 1、MeRIP-qPCR的目的是什么? MeRIP-qPCR是验证某目标基因上的某个修饰位点(以一小段区域的形式,MeRIP法精确不到单碱基)的修饰水平。得到的结果往往是一个%(IP/Input)的数值,它体现的是该位点的修饰水平(可以理解为:这个转录本表达了很多条,其中这个位点有修饰的有多少条?)。与普通qPCR验证...