1、平台完整: MeRIP实验—建库测序分析—MeRIP qPCR验证,真正一站式服务 2、高成功率:成功开展超过1000例样本,支持低至ng级别RNA建库 3、灵活选择:建库方式和文库片段大小可选 4、重复性好:丰富的项目经验确保实验重复性,已进行多样本间的比较分析 项目样品准备 ...
● 平台完整: MeRIP实验—建库测序分析—MeRIP qPCR验证,真正一站式服务 ● 高成功率:成功开展超过1000例样本,支持低至ng级别RNA建库 ● 灵活选择:建库方式和文库片段大小可选 ● 重复性好:丰富的项目经验确保实验重复性,已进行多样本间的比较分析 实验流程与项目流程 ...
CT26细胞的MeRIP-seq测序分析结果表明RELA(p65)mRNA的最后一个外显子(last exon)或3’UTR上的m6A修饰。 设计MeRIP-qPCR引物以验证p65 mRNA上的m6A修饰。潜在的m6A位点以红色标出(上),MeRIP-qPCR引物用箭头表示。MeRIP-qPCR用引物#2和#3(较低)验证了m6A修饰。 YTHDF1-RIP测序分析结果表明,与IgG对照相比,p65 m...
下游荧光定量PCR中是片段化的RNA对应的cDNA片段(200nt左右),需要设计甲基化位点特异性的引物进行qPCR 下游sequence测序时的插入片段也是短的cDNA片段(100nt左右) 优势: 可以大致确定甲基化位点所在的区域,精确到100-200nt的范围。 劣势: 1、在荧光定量PCR时需要准确预测可能的修饰区域,才能把引物设计好,如果预测的区...
设计MeRIP-qPCR引物以验证p65 mRNA上的m6A修饰。潜在的m6A位点以红色标出(上),MeRIP-qPCR引物用箭头表示。MeRIP-qPCR用引物#2和#3(较低)验证了m6A修饰。 YTHDF1-RIP测序分析结果表明,与IgG对照相比,p65 mRNA富集(左)。YTHDF1-RIP-qPCR的小鼠p65 mRNA特异性引物(右)。
使用抗YTHDF1抗体的RIP-qPCR也证实了人CRC细胞中YTHDF1和p65 mRNA之间的直接互作(图5G)。体内验证YTHDF1和p65的相关性实验结果表明,在YTHDF1敲入小鼠中,CRC细胞中的p65和磷酸化p65蛋白均增加(图5H)。总之, YTHDF1促进p65蛋白...
中文题目:ALKBH5介导的HO-1 mRNA的N6 -甲基腺苷修饰调节钴诱导的神经退行性损伤中的铁凋亡 期刊:Environment International 影响因子:10.3 发表日期:2024年7月17日 DOI:doi.org/10.1016/j.envint.2024.108897. 研究方法:RNA pull down -MS,m6A MeRIP-Seq,m6A MeRIP-qPCR等方法 ...
设计MeRIP-qPCR引物以验证p65 mRNA上的m6A修饰。潜在的m6A位点以红色标出(上),MeRIP-qPCR引物用箭头表示。MeRIP-qPCR用引物#2和#3(较低)验证了m6A修饰。 YTHDF1-RIP测序分析结果表明,与IgG对照相比,p65 mRNA富集(左)。YTHDF1-RIP-qPCR的小鼠p65 mRNA特异性引物(右)。
2. MeRIP-qPCR 引物设计有什么需要注意的地方? Re: 需要注意的地方主要有两点:1.逆转录时,需采用随机引物进行逆转录.2. PCR 产物长 度需要控制在 200 bp 以下. 7 http-equiv="content-type"
3. 组学+实验验证,深入探究机制。可以探究m6A的上游调控基因(m6A甲基化/去甲基化基因)变化的机制,还可以研究m6A对下游基因的影响,同时还需要结合RT-qPCR、RIP或Western blot等实验来进行验证。这一点也是发高分文章的关键。 下面小编就以这篇基迪奥客户中国医科大学附属盛京医院药学部李馨阳团队在《Advanced Science》...