序列(SEQUENCE)是序列号生成器,可以为表中的行自动生成序列号,产生一组等间隔的数值(类型为数字)。其主要的用途是生成表的主键值,可以在插入语句中引用,也可以通过查询检查当前值,或使序列增至下一个值。 1、创建序列 注:需要CREATE SEQUENCE系统权限。 CREATE SEQUENCE 序列名 [INCREMENT BY n] [START WITH n...
输出位置: 默认值为 meme_out/目录。如果这个目录不存在,会新建一个。输出的文件会有meme.html,meme.xml, meme.txt, meme.xsl以及一些LOGO图片。当然你也可以设置输出的位置。 -o 输出目录名;如果已经存在的话不覆盖该目录; -oc 输出目录名;如...
序列(SEQUENCE)是序列号生成器,可以为表中的行自动生成序列号,产生一组等间隔的数值(类型为数字)。其主要的用途是生成表的主键值,可以在插入语句中引用,也可以通过查询检查当前值,或使序列增至下一个值。 1、创建序列注:需要CREATE SEQUENCE系统权限。 CREATE SEQUENCE序列名 [INCREMENT B ...
序列(SEQUENCE)是序列号生成器,可以为表中的行自动生成序列号,产生一组等间隔的数值(类型为数字)。其主要的用途是生成表的主键值,可以在插入语句中引用,也可以通过查询检查当前值,或使序列增至下一个值。 1、创建序列 注:需要CREATE SEQUENCE系统权限。 CREATE SEQUENCE 序列名 [INCREMENT B ...
③ 提交序列(红框):选择“Upload sequences”上传包含序列的FASTA文件,上传完文件后,MEME网站会自动检测是蛋白序列还是DNA序列;或选择“Type in sequences”直接将序列粘贴到文本框中。 ④ 设置参数(黄色框):Site Distribution根据对序列中motif分布的预期选择,如“zero or one per sequence”表示每个序列中motif出现...
MEME(Motif-based sequence analysis tools)使用说明 MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据,当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列,这就是蛋白质与DNA相到作用所保护下来的片段。所以使用MEME搜索其中非常相似的序列片段就可能是有一定功能...
只有minw和maxw是自己设置的,minw=5 因为我的文件最短的sequence是5(其实一般设置6或者8),maxw=30 因为网页版最大支持30. 命令行版本如下: meme $1 -dna -oc . -nostatus -time 18000 -mod zoops -nmotifs 1000 -minw 5 -maxw 50 -objfun classic -revcomp -markov_order 0 -evt 0.05 -o $...
④ 设置参数(黄色框):Site Distribution根据对序列中motif分布的预期选择,如“zero or one per sequence”表示每个序列中motif出现0次或1次,为默认选项;“one per sequence”表示每个序列中恰好出现1次;“any number of repetitions”表示每个序列中可出现任意次。
1、创建序列 注:需要CREATE SEQUENCE系统权限。 CREATE SEQUENCE 序列名 [INCREMENT B meme数据库保守序列 最小值 生成器 序列号 转载 风之谷启航 4月前 128阅读 生物信息之多序列比对,进化树分析,保守位点分析 序列下载与整理 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene下载fasta格式序列输入你想查找的序列...
1、创建序列 注:需要CREATE SEQUENCE系统权限。 CREATE SEQUENCE 序列名 [INCREMENT B meme数据库保守序列 最小值 生成器 序列号 转载 风之谷启航 5月前 128阅读 生物信息之多序列比对,进化树分析,保守位点分析 序列下载与整理 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene下载fasta格式序列输入你想查找的序列...