1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。 http://www.megasoftware.net/ 2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找 >NP_191351.1 SPL15 [organism=Arabidopsis thaliana] [GeneID=824961] MELL...
完成后出现两个文件 4、mega7 打开 file---convert file format to MEGA 导入刚刚的aln文件,点击OK 命名保存 ok 5、构建树 也可以从Analysis进入,点击建树 导入刚刚保存的文件,OK-COMPUTE 6、树跑好后保存文件 点击这个保存,后用mega打开仍会显示进化树,可以进行美化 或输出Newick格式,后用进化树美化网站(iTOL...
1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。 http://www.megasoftware.net/ 2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找 >NP_191351.1SPL15[organism=Arabidopsis thaliana][GeneID=824961]MELLMCSGQ...
1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。 http://www.megasoftware.net/ 2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找 >NP_191351.1SPL15[organism=Arabidopsis thaliana][GeneID=824961]MELLMCSGQ...
1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。 http://www.megasoftware.net/ 图片 图片 2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找 >NP_191351.1 SPL15 [organism=Arabidopsis thaliana] [GeneID=...
53 0 01:12 App MEGA 10 生信进化树分析 下载安装方法,免激活 38 0 01:10 App MEGA-X 构建进化树工具 安装包一键安装下载教程,零基础弄明白 80 0 01:10 App MEGA-X 构建进化树工具 安装包一键安装下载教程,小白快速学会 165 0 01:18 App MEGA 10 生信进化树分析 免费下载链接,全网最全面的 38.9万...
随着生物技术的飞速发展，掌握生信工具的使用变得至关重要。本文将指导如何使用MEGA7构建进化树。首先，从MEGA7的下载地址开始，选择适合自己系统的版本。确保你的序列数据为fasta格式，如拟南芥SPL15基因的蛋白序列，选择同源序列高的前19条进行下载。导入蛋白序列时，可以从File菜单栏导入或直接拖入软件。接...
点击MEGA主窗口上的Phylogeny下拉菜单,选择Neighbor Joining(最近邻居法)。弹出窗口询问是否使用当前 .meg里面的数据,选Yes。接下来,弹出参数设置窗口(Analysis Preferences)。参数设置对构建的系统发生树的准确程度非常重要。在树构建好之后,还经常需要根据树的具体情况,重新设置参数,并重新建树,如此反复,纸质结果令人满意...
1. 将要用于构建系统进化树的所有序列合并到同一个 fasta 格式文 件,注意:所有序列的方向都要保持一致 ( 5’-3’)。 想要做系统发生树先要做多序列比对,然后把多序列比对的结果 提交给建树软件进行建树,所以在用 MEGA 建树时可以输入一个已 经比对好的多序列比对,也可以输入一条原始序列,让 MEGA 先来 做多...
1. 打开软件后，选择File选项，将ClustalX的多序列比对结果文件转换为Mega7可读的格式；2. 在软件内构建进化树，选择合适的进化模型、分支可信度评估方法等参数；3. 运行树构建算法，等待树构建完成；4. 最后，保存构建的进化树文件，以便后续分析与分享。通过ClustalX进行序列比对和Mega7构建进化树，为...