单端测序(Single-read)和双端测序(Paired-end和Mate-pair)的关系 目前3种测序技术 Roche 454,illumina Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。 在基因组De Novo测序过程中,Roche 454的单端测序读长可以达到400 bp,经常用于基因组骨架的组装,而Solexa和ABI
单端测序(Single-read)和双端测序(Paired-end和Mate-pair)的关系 目前3种测序技术 Roche 454,illumina Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。 在基因组De Novo测序过程中,Roche 454的单端测序读长可以达到400 bp,经常用于基因组骨架的组装,而Solexa和ABI SOLID双端测序可以用于组装scaffolds和填补gap。
网络配对 网络释义 1. 配对 配对(Mate-Pair)分析有助于精确定位重复区域内或附近的读出序列,而这在个体间通常差异很大。SOLiD系统的这种能力有 …www.antpedia.com|基于3个网页您要找的是不是 mater make spare matter Maker make peace 必应词典应用 准确权威无广告去官网了解更多...
配对分析(mate-pair analysis),即遗传分析系统分析由已知距离隔开的序列两端的能力,让科研人员能精确定位这些序列在基因组 …www.ebiotrade.com|基于5个网页 2. 配对末端分析 这种方法结合了SOLiD 系统的配对末端分析(mate-pair analysis)能力,来对整个基因组所有区域包括启动子、基因区和重复元件 …www.docin.com|...
Mate-pair sequencing identifies a cryptic BMPR2 mutation in hereditary pulmonary arterial hypertensionBMPR2mutationgenetic testCo-first authors; these authors contributed equally to this manuscript. Current guidelines suggest screening all patients with idiopathic pulmonary arterial hypertension for genetic ...
单端测序(Single-read)和双端测序(Paired-end和Mate-pair)的关系目前3种测序技术Roche454,Solexa和ABISOLID均有单端测序和双端测序两种方式。在基因组DeNovo测..
insert size|single-read|Paired-end|Mate-pair (测序方面):测三只大熊猫;得到的insert size有150bp,500bp,2kb,5kb和10kb这四种,可测得序列长度和平均reads长度。 为什么average reads这么短? 因为insert size是打断前的长度,打断之后便是reads,这里计算average reads长度。
所以,使用paried-end序列时需要确定要不要对序列进行反向互补处理,需要通过reverse_seq来指定。假如对mate-pair产出的reads提前进行了反向互补处理,则reverse_seq=0即可。
Mate pair sequencing enables generation of long-insert paired-end DNA libraries for de novo sequencing, structural variant detection, and other applications.
Figure 1. Distribution of 378 genomic events identified by mate-pair sequencing in 11 cases of PTCL, NOS. (A) Number of genomic events per case. (B-D) Representative Circos diagrams illustrating heterogeneity in the degree of complexity of genomic events among PTCLs: (B) high complexity; (...