这个分支在kegg通路图的最上面,其中的MAPK酶是ERK1/ERK2 (p42/p44)激酶。这是被研究的最为广泛最经典的MAPK通路,其与肿瘤有千丝万缕的关系,其中任何一个关键蛋白的功能异常,都可能导致肿瘤发生,这个通路的过程在上期文章图5展示过(文章链接:《MAPK通路(ko04010)专题解析(上)》),截取kegg通路中属于这个分支的部...
2795、4198个;差异表达基因KEGG富集分析显示多种代谢途径参与褪黑素调控酸枣抗盐胁迫,其中MAPK 信号通路(MAPK signaling pathway)和植物激素信号转导(Plant hormone signal transduction)通路中涉及褪黑素调控盐胁迫的关键基因;另外,一些转录因子家族,如WRKY、bHLH、MYB、NAC也与外源褪黑素调控盐胁迫有关...
在检索信号通路时,常用的数据库就是KEGG数据库。 在伴学营中,老师会详细介绍KEGG数据库的常用功能,以及如何利用AI工具快速学会使用KEGG数据! 学会本节课后,无需你再费劲心思找KEGG数据库的使用方法,绞尽脑汁想如何做信号通路相关的课题设计! 以上仅部分课程内容介绍~全部内容点击报名~ 写在最后: 目前信号通路还是能...
LC组与CON组的DEGsKEGG通路分析(图4C)显示,这些基因参与了多种免疫反应相关通路。这些通路中的关键基因,在LC与CON组中表达上调,但在LH与LC组中表达下调(p<0.05,图4E)。LH与LC组的DEGs富集在免疫调节相关通路,包括MAPK信号通路、钙信号通路和mTOR信号通路(图4D),关键基因如AKT1、MAP3K11、MAP4K2、MAPK7和MAPK1...
图1:MAPK信号通路 (https://www.kegg.jp/tmp/search_pathway_text//map04010_org_2020100615454616248.png?) MAPK信号通路: MAPK级联信号传导通路核心部分可以大概分成3个不同层次:MAPK、MAPKK、MAPKKK 。而上游MAPKKK通过与小GTPase和/或其他蛋白酶相互作用而被激活,从而将MAPK和MAPK信号刺激因素联系在一起,实现细胞...
02信号通路的筛选方法在伴学营课程中,老师也会讲到信号通路的筛选方法,包括常用的信号通路筛选方法和生物芯片筛选方法.03检索信号通路的数据库在检索信号通路时,常用的数据库就是KEGG数据库。在伴学营中,老师会详细介绍KEGG数据库的常用功能...
随后的KEGG分析表明,PD数据集中的基因主要与MAPK信号通路、cAMP-PKG信号通路、PI3K-Akt信号通路和突触囊泡周期相关(图6B)。 值得注意的是,SLC6A12主要聚集在细胞衰老和突触囊泡周期中(图6C)。最后,PPI网络发现了与SLC6A12表达模式相似的蛋白,包括REL、RELA、NFKB1、RELB、NFKBIE、NFKBIB等(图6D)。综上所述,SLC...
原名:Morinda Officinalis -Derived Extracellular Vesicle-like Particles: Anti-Osteoporosis Effect by Regulating MAPK Signaling Pathway 译名:巴戟天衍生的细胞外囊泡样颗粒:通过调节MAPK信号通路抗骨质疏松 期刊:Phytomedicine IF:7.9 发表时间:2024.4 通讯作者:赵可伟、赵清 ...
通过GO和KEGG通路分析,研究者观察到在MOEVLPs处理下,MC3T3-E1细胞中的丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路被显著激活(图6A)。进一步分析发现,与MAPK通路相关的关键蛋白,如CREB和RSK1,其表达水平亦呈现出显著增长趋势(图6B-6C)。特别是,MAPK通路在调控细胞基本过程,如增殖、分化和凋亡等方面,具有显著作用。
GSEA分析揭示了PF对多条重要信号通路及生理过程的调控作用,包括但不限于MAPK信号通路、mTOR信号通路、细胞凋亡等。结合GO分析与KEGG富集的结果,MAPK信号通路在差异基因分析中脱颖而出,其在三组对比中均呈现出较高的显著性,且表现趋势一致(图6C–F)。