# 假设我们有一个环境叫 ehbio,可以导出为一个yml文件 conda env export --file ehbio_env.yml --name ehbio # 然后换一台电脑,就可以完全重现这个环境了 # 这么做的另一个优势是yml中明确列出了软件的版本, # 使用 conda solving environment时速度会快很多 conda env create -f ehbio_env.yml 1. 2. 3...
conda install -c r r-base=4.0.2 r-essentials # 安装单个包 # conda install -c https://conda.binstar.org/bokeh ggplot 更新包 # 更新基础conda,新版本conda使用起来更快 conda update -n base -c defaults conda conda update r-base 获取帮助信息 conda -h # 查看conda可用的命令 conda install -h...
conda install numpy=1.7.2 -y # 安装特定版本的软件包 conda remove <package name> # 移除软件包 安装R 更新包 # 更新基础conda,新版本conda使用起来更快 conda update -n base -c defaults conda conda update r-base 获取帮助信息 conda -h # 查看conda可用的命令 conda install -h #查看install子命令...
# conda-lock install -n YOURENV --file conda-lock.yml # To update a single package to the latest version compatible with the version constraints in the source: # conda-lock lock --lockfile conda-lock.yml --update PACKAGE # To re-solve the entire environment, e.g. after changing a ver...
environment.yml name: EckEnv channels: - bioconda - conda-forge dependencies: - pandas - bioconda::pyvcf3 - scipy ~/.condarc changeps1: false EDIT: Hi again, I just wanted to add some more information to this problem. I have tested conda and micromamba in a linux machine with an older...
They are not tied to any particular libmamba version (I've seen it in several versions across the 1.x and 2.x series) mamba info / micromamba info N/A Logs See https://github.com/conda/conda-libmamba-solver/issues/334 environment.yml ...
下载完成后,进入下载完成的whl文件目录,再进入你的conda环境,pip install ***.whl文件名安装 3. bimamba等import错误:ImportError: cannot import name ‘bimamba_inner_fn’ from ‘mamba_ssm.ops.selective_scan_interface’ 以及在from mamba_ssm.ops.selective_scan_interface import bimamba_inner_fn, bimamba...
conda install <package name> # 安装软件包 # -y是同意安装,不写的话会弹出提示,需要再次确认 conda install numpy=1.7.2 -y # 安装特定版本的软件包 conda remove <package name> # 移除软件包 1. 2. 3. 4. 安装R # 具体见下面 # 安装R,及80多个常用的数据分析包, 包括idplyr, shiny, ggplot2,...
mamba install -y -n base -c conda-forge wget ARG MAMBA_DOCKERFILE_ACTIVATE=1 RUN wget https://data.qiime2.org/distro/amplicon/qiime2-amplicon-2024.2-py38-linux-conda.yml # Install dependencies RUN micromamba install -y -n base -f /tmp/qiime2-amplicon-2024.2-py38-linux-conda.yml && ...
使用Python的一定对著名的科学计算集成环境Anaconda（miniconda）并不陌生，而无论是使用Anaconda还是miniconda...