进行MALDI-TOF-MS分析过程中可优化脉冲激光、模式、加速电压、激光强度等参数,最终获得理想的质谱图。MALDI-TOF质谱数据分析过程中,需要对得到的谱图进行肽质量指纹谱(PMF)数据库搜索,将数据库中的蛋白序列理论酶切成肽段,计算其理论图谱,与实验图谱进行比对得到结果(扣除基质本底、酶自切和角蛋白污染峰)。此...
首先对来自三个国家经RT-PCR检测的362个鼻拭子样本(211个阳性,151个阴性)进行MALDI-TOF MS检测,后分别使用六种机器学习算法对所得谱图进行分析,对不同的机器学习算法进行评估后,支持向量机-径向基核函数(support vector machine with a radial kernel, SVM-R)模型具有最高的诊断准确度(93.9%),区分COVID-19患...
dNTP)和引物,然后加入一单碱基延伸引物,其3’末端碱基紧挨SNP位点,采用四种ddNTP替代dNTP。这样,探针在SNP位点处仅延伸一个碱基,连接上的ddNTP与SNP位点的等位基因对应。用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 检测延伸产物与未延伸引物间的分子量差异,确定该点处碱基。
MALDI-TOF MS质谱仪主要由离子源、飞行时间分析器和离子检测器三部分组成。将待检样品与基质液点在金属靶板上,待溶剂完全挥发后二者形成共结晶,利用离子源发射激光照射共结晶薄膜时,基质分子会吸收能量与样品解吸附并使其电离,电离的生物分子在电场作用下加速通过真空飞行管,根据不同带电离子到达检测器的时间及离...
微生物的质谱鉴定基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)所生成的蛋白图谱分析开展,这一技术克服了传统生化表型鉴定方法操作复杂、检测时间长、效率低的短板,从技术上提升了临床微生物的检验能力,因此在临床得到了快速的应用。2020年10月,胡继红和丛玉隆发表的《我国临床微生物实验室现状与分级诊疗下实...
许多科学家设计了用MALDI-TOF质谱分析AST的多种方法。①抗生素降解检测②检测抗生素耐药菌株的特殊标志物③细菌表型耐药性分析c.通过MALDI-TOF MS肽/蛋白质谱进行细菌的分型鉴定微生物的局限性MALDI-TOF-MS鉴定丝状真菌的主要局限性在于参考谱。菌谱信息库的持续更新和样本恰当的富集方法是将增加MALDI-TOF-MS在微生物...
MALDI-TOF质谱法的过程 图2 MALDI-TOF质谱分析 MALDI的技术特点 与电子轰击电离和化学电离等其他质谱电离技术相比,MALDI技术具有以下特点: 1. 可以电离一些难以通过其他电离技术电离的样品(尤其是生物大分子),并获得没有明显碎片的完整电离产物; 2. 具有主要的单电荷分子离子峰...
TOF分析器根据m/z分离这些生成的离子,MS软件生成和分析这些离子的谱表征,最终生成MS谱图。MALDI-TOF质谱的应用 完整质量测定:完整的质量测定是蛋白质表征的基础且至关重要,因为一个蛋白质的正确分子量可以指示完整的结构。MALDI是一种软电离技术,适用于通过其他电离方法电离时易碎的蛋白质。MALDI-TOF MS的性能受...
MALDI-TOF质谱仪(如图1,以Bruker为例)由离子源、质量分析仪和离子检测器三个部分组成。 图1.Bruker Microflex 其检测原理如图2所示[2]:将待测样品与金属靶板上的基质液混合,在基质液和微生物材料形成共结晶后,将金属板放入质谱仪并用激光脉冲短暂轰击。解析和电离的带电生物分子通过静电场加速,并通过真空飞行管...
基质辅助激光解析电离飞⾏时间质谱MALDI-TOF-MS MALDI-TOF-MS(基质辅助激光解析电离飞⾏时间质谱)是近年来发展起来的⼀种新型的简单⾼效软电离⽣物质谱仪。质谱分析法主要是通过对样品的离⼦的质荷⽐的分析⽽实现对样品进⾏定性和定量的⼀种⽅法。因此,质谱仪都必须有电离装置把样品电离为离...