该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了葡萄中一个MADS-box转录因子的结合基序及其靶基因,揭示了VvMADS28参与葡萄胚珠和种子发育的调控机制,为培育无籽葡萄新品种奠定了理论基础。 MADS-box基因编码高等植物中的一大类转录因子,并在植物发育过程中发挥各种作用,包括花、果实和种子发育。MADS结构域蛋白通常以同
MADS-box 基因家族的保守特征是在N端的MADS-box DNA结合域(M),植物中很多MADS-box 基因还含有保守...
这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达。每个MADS box蛋白都有一个特定的DNA结合位点,这个位点通常位于目标基因的启动子区域。通过这种方式,MADS box蛋白可以调控细胞的生长、分化和发育过程。
MADS-box家族成员参与植物生长发育调控。 在这项研究中,使用下拉分析结合液相色谱-串联质谱法,将MADS结构域转录因子AGAMOUS-LIKE 9(PsAGL9)鉴定为PsRGL1的候选相互作用蛋白。低温和外源GA3诱导PsAGL9表达。酵母双杂交(Y2H)、下拉和萤光素酶互补试验(LCA)证实了PsAGL9与PsRGL1相互作用。 PsAGL9的过表达显著促进了休...
[A/T]6GG,称为 CArG-box[9];I 结构域相对保守,可选择性地结合 DNA 序列形成二聚体分子[10];K 结构域为半保守结 构域,包括 K1,K2 和 K3 三个 α 螺旋,通过调控蛋 白质间的相互作用来控制基因表达[11];C 结构域保 守性最低,可能为 MADS-box 基因的转录激活区域, 与蛋白因子二聚体复合物的形成...
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了葡萄中一个MADS-box转录因子的结合基序及其靶基因,揭示了VvMADS28参与葡萄胚珠和种子发育的调控机制,为培育无籽葡萄新品种奠定了理论基础。 MADS-box基因编码高等植物中的一大类转录因子,并在植物发育过程中发挥各种作用,包括花、果实和种子发育。MADS结构域蛋白通常以同...
转录组学分析表明,花蕾的形成与MADS-box转录因子(TF)家族基因EjCAL的表达有关。RNA荧光原位杂交表明,EjCAL在花原基中富集,而在茎尖分生组织中几乎没有检测到。EjCAL在烟草植株中的异源表达导致早期FBD。酵母单杂交分析确定ERF12 TF是EjCAL启动子的结合伴侣。染色质免疫沉淀-PCR证实EjERF12与EjCAL启动子结合,β-...
摘要 基因的重复(duplication)及其功能的多样性(diversification)为生物体新的形态进化提供了原材料。MADS-box基因在植物(特别是被子植物)的进化过程中发生了大规模的基因重复事件而形成一个多基因家族。MADS-box基因家族的不同成员在植物生长发育过程中起着非常重要的...
2 结果 2.1 CqMADS-box基因家族成员的鉴定,系统发育 树的构建及命名 结合同源比对(BLASTP) 和隐马尔可夫模型 (HMM)结构域预测结果,在藜麦基因组中鉴定出 117 个基因属于 MADS-box 家族(附表 1).其中有 55 个基因只含有 MADS 结构域,15 个基因只含有 K-box 结构域,47 个基因同时含有 MADS 结构域和 K-...
(1.福建农林大学园艺学院;2.福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福建福州350002)摘要:利用生物信息学方法,从全基因组水平鉴定枇杷MADS⁃box基因家族成员,并对其系统进化关系㊁保守结构域㊁基因结构㊁基因复制和启动子顺式作用元件进行分析;同时,结合转录组数据和qRT⁃PCR结果,...