MADS-box基因家族基因是一类广泛存在于植物中的转录因子,高等植物中MADS基因由4个保守程度不一的区域组成,分别是MADS区、I(intervening)区、K (keratin-like)区和C末端(M-I-K-C domain structure)。 根据系统进化可以把MADS-box分为两类:I型和II型。大多数植物MADS基因,包括所有功能特异的真核生物MADS基因和动...
2.1. 在TKS和TM基因组中鉴定蒲公英MADS-box基因 为了全面地鉴定TKS和TM中的MADS-box基因,我们通过BLAST和HMMER搜索筛选了已发表的基因组数据。此外,我们还将拟南芥MADS-box蛋白序列用作查询,对TKS和TM基因组数据库进行了BLASTP搜索。然后,我们认为在物理位置相同或相似度超过99%的基因是同一个基因。最终,在TKS基因...
ZlMADS-box蛋白被很好地分类,所有成员都能够正确分类,显示MADS-box基因在植物中高度保守。 经过进一步比较分析,阿拉伯芥的MADS-box基因通常集中在一个聚类中,特别是在I型蛋白中更为明显,而茭白和水稻的蛋白则在各个亚家族中交叉分布,这表明ZlMADS-box蛋白在系统发育上更接近水稻MADS-box转录因子。 <<——【·结果...
摘要:通过生物信息学的方法,利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家族进行鉴定和分析,共得到83个草莓MADS-box候选基因,且MADS-box结构域高度保守。进化分析表明,FvMADS1-FvMADS33可被细分为10个亚组,分别为AG、AGL12、AGL6、AGL2、SE、SVP、FLC、AP3、SOC1、AGL17;FvMADS34-FvMADS83可被细分为...
先查看文献,了解大概MADS基因家族分类,如下图 image.png 参考文献:王力娜, 范术丽, 宋美珍, et al. 植物MADS-box基因的研究进展[J]. 生物技术通报, 2010, 000(008):12-19. 在NCBI中下载拟南芥中MADS的几段蛋白质序列,在TAIR中BLASTP找到相似序列(E-value均小于10^-5)。再TAIR - TOOL - Bulk Data Retr...
MADS-box是一类植物中规模最大的转录因子家族，在植物生长发育调控和信号传导中发挥着重要作用，可分为I型和II型两个亚家族。II型亚家族除含有MADS结构域外，还可能含有I、K和C结构域，因此又被称为MIKC类型。小麦中著名的开花基因VRN1和AP1就属于MIKC类型的MADS-box基因家族，在小麦春化和开花调控中发挥着重要...
MADS box基因家族是一类转录因子,它们在植物的发育过程中起着关键作用。这些基因编码的蛋白质包含一个保守的结构域,称为MADS盒(MCM1,AGAMOUS,DEFICIENS和SRF)。这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达。每个MADS box蛋白都有一...
甜菜 MADS-box 家族基因虽然基因结构差别较大,但蛋白序列相对保守。 基因表达谱显示,大部分MADS - box 基因优势表达于分生组织,部分 MADS-box 基因在种子、直根、幼叶等组织亦有较高表达。 部分 MADS-box基因响应盐、热胁迫轻微上调,可能参与甜菜逆境生理调控。关键词:甜菜;MADS-box;全基因组;家族基因中图分类号...
mads-box基因家族成员与药用植物白花发育调控.docx,mads-box基因家族成员与药用植物白花发育调控 1 花发育的基因家族 水生植物通常被称为开花植物,根据分子系统论,它主要包括真水生植物和假水生植物。模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)分别属于真