ZlMADS-box蛋白被很好地分类,所有成员都能够正确分类,显示MADS-box基因在植物中高度保守。 经过进一步比较分析,阿拉伯芥的MADS-box基因通常集中在一个聚类中,特别是在I型蛋白中更为明显,而茭白和水稻的蛋白则在各个亚家族中交叉分布,这表明ZlMADS-box蛋白在系统发育上更接近水稻MADS-box转录因子。 <<——【·结果...
对筛选出的MADS-box家族蛋白序列,利用Expasy(https://web.expasy.org/protparam/)分析甘松MADS-box转录因子家族成员的蛋白相对分子质量、理论等电点等基本理化性质,利用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)预测甘松MADS-box蛋白二级结构,利用MEME(https://memesuite.o...
MEME-ChIP 软件显示,最常见的 SlMBP3 结合序列对应于 10-bp CC(A/T) 6CArG-box 的 GG 基序与其他番茄 MADS 转录因子如 RIN、FUL1 和 FUL2 21的已知结合位点相匹配(图 5d)。交叉引用ChIP-seq 和 RNA-seq 数据确定了 450 个基因既是SlMBP3靶标,又在SlMBP3 -KO 眼组织中显示差异表达(图 5e)。因此...
MEME-ChIP 软件显示,最常见的 SlMBP3 结合序列对应于 10-bp CC(A/T) 6CArG-box 的 GG 基序与其他番茄 MADS 转录因子如 RIN、FUL1 和 FUL2 21的已知结合位点相匹配(图 5d)。交叉引用 ChIP-seq 和 RNA-seq 数据确定了 450 个基因既是SlMBP3靶标,又在SlMBP3 -KO 眼组织中显示差异表达(图 5e)。因...
最近一项研究聚焦十字花科不同属的自然变异, 发现3 个亲缘关系密切的MADS-box类转录因子编码基因(即FLC,FLM和MAF)与其一年生/多年生习性转变相关, 并解析了其分 子机制, 提出十字花科植物生活史策略(即多年生/二年生/一年生之间的转换)是由FLC类MADS-box基因剂量叠加所决定的 连续过程.研究结果初步明确了十字花科...
本发明涉及转录因子,尤其涉及从苦荞麦(fagopyrum tataricum(l.)gaertn)中分离的mads-box类转录因子及其编码基因,本发明进一步涉及它们在调控黄酮类物质生物合成中的应用,属于mads-box类转录因子及其应用领域。 背景技术: 1、荞麦为蓼科(polygonaceae)荞麦属(fagopyrum)的双子叶植物,苦荞麦含有丰富的次生代谢产物,如黄酮类...
从全基因组水平鉴定枇杷 MADS-box 基因家族成员,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构、基因复制和启动子顺式作用元件进行分析;同时,结合转录组数据和 qRT-PCR 结果,分析鉴定出的 MADS-box 基因家族成员在不同品种和不同成熟阶段的表达情况.本研究共鉴定出 89 个枇杷 MADS-box 基因(命名为 EjMADS1～EjMADS...
普通小麦（中国春）中一共鉴定到201个MIKC类型的MADS-box基因成员，其中有164个基因同时含有MADS结构域和K结构域。这两个结构域在DNA结合和蛋白复合体形成过程中发挥关键作用，大约有14%和7%的基因分别缺少了K结构域和MADS结构域，可能对他们自身的功能产生影响。对拟南芥、水稻和小麦中的MIKC基因成员进行聚类分析后...
植物MADS_box基因研究进展_黄方
2 MIKC 型 MADS-box 蛋白与 DNA 的相互 作用 MADS 域可用于 DNA 绑定和蛋白二聚化, MADS 域是 MADS 蛋白序列中最保守的序列[5].据报道, 大部分 MADS-box 蛋白都会绑定到 SRE 型 CArG 盒[即 5'-CC(A/T)6GG-3']的 DNA 序列元件 上, 如人类 MEF2A 蛋白,MIKC 型 SEP3 蛋白[21]. 但是并不...