这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达。每个MADS box蛋白都有一个特定的DNA结合位点,这个位点通常位于目标基因的启动子区域。通过这种方式,MADS box蛋白可以调控细胞的生长、分化和发育过程。
免疫沉淀DNA 的测序揭示了 2363 个峰,其中 48.2% 位于注释基因上游的 3-kb 区域内(图 5c)。MEME-ChIP 软件显示,最常见的 SlMBP3 结合序列对应于 10-bp CC(A/T) 6CArG-box 的 GG 基序与其他番茄 MADS 转录因子如 RIN、FUL1 和 FUL2 21的已知结合位点相匹配(图 5d)。交叉引用ChIP-seq 和 RNA-seq ...
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了葡萄中一个MADS-box转录因子的结合基序及其靶基因,揭示了VvMADS28参与葡萄胚珠和种子发育的调控机制,为培育无籽葡萄新品种奠定了理论基础。 MADS-box基因编码高等植物中的一大类转录因子,并在植物发育过程中发挥各种作用,包括花、果实和种子发育。MADS结构域蛋白通常以同型...
VvMADS28特异性地与VvWUS启动子区的CArG基序结合,抑制VvWUS的表达,且VvMADS28(MADS-box II型MIKC分支)可与VvMADS5(MADS-box I型Mβ分支)互作协同调控这一过程。因此,VvMADS28-VvMADS5二聚体的维持以及VvWUS的表达稳态,影响了葡萄花器官分化以及珠被细胞和胚乳细胞的发育。总之,该研究揭示了VvMADS28在葡萄种子...
VvMADS28特异性地与VvWUS启动子区的CArG基序结合,抑制VvWUS的表达,且VvMADS28(MADS-box II型MIKC分支)可与VvMADS5(MADS-box I型Mβ分支)互作协同调控这一过程。因此,VvMADS28-VvMADS5二聚体的维持以及VvWUS的表达稳态,影响了葡萄花器官分化以及珠被细胞和胚乳细胞的发育。总之,该研究揭示了VvMADS28在葡萄...
MADS-box 基因表达模式的多样性和功能的复 杂性证明了其内在的精巧机制.研究表明,种子植物 的 MADS-box 蛋白高度保守,具有 MADS( M) ,Interve- ning( I) ,Karatin-like( K) 和 C 端( C) 4 个结构域,所以 又称为 MIKC 类 MADS-box 基因,N 端 MADS 结构域 最为保守,为 DNA 结合位点.根据该...
而后,分析了作为三个分支代表的九个细胞壁相关基因的ChIP-seq数据,结果显示其中存在高度保守的CArG-box基序的富集峰,该基序为已报道的MADS转录因子的结合位点。该结果进一步表明,9个细胞壁相关基因为SlMBP3的靶基因。 SlMBP3-KO株系中细胞壁相关差异表达基因的表达模式...
box 转录因子都属于 II 型,而大多数 II 型转录因子 又属于 MIKCC 型,此类转录因子基因大多由 7 个外 显子和 6 个内含子组成[8].MADS-box 蛋白拥有高 度保守的 MADS 结构域,能以二聚体的形式结合靶 基因上游一段 DNA 核心序列 CC[A/T]6GG,称为 CArG-box[9];I 结构域相对保守,可选择性地结合 ...
MEME-ChIP 软件显示,最常见的 SlMBP3 结合序列对应于 10-bp CC(A/T) 6CArG-box 的 GG 基序与其他番茄 MADS 转录因子如 RIN、FUL1 和 FUL2 21的已知结合位点相匹配(图 5d)。交叉引用 ChIP-seq 和 RNA-seq 数据确定了 450 个基因既是SlMBP3靶标,又在SlMBP3 -KO 眼组织中显示差异表达(图 5e)。
转录因子常在生物的发育或信号转导中发挥重要作用,MADS-box家族基因是其重要的组成部分[3]。MADS-box基因家族成员拥有保守的N端结构,由大约60个氨基酸组成,与CArG位点结合后参与下游信号途径[4]。目前,已有许多研究解析了不同物种的MADS基...