在NCBI中下载拟南芥中MADS的几段蛋白质序列,在TAIR中BLASTP找到相似序列(E-value均小于10^-5)。再TAIR - TOOL - Bulk Data Retrieval中批量下载,如图 image.png 再在SMART批量搜索以上序列是否含有MADS结构域。其中AT1G77080.2, AT4G09960.3, AT3G57390.3, AT5G51870.2, AT5G23260.4, AT5G51870.4不包含MADS结构...
TKS和TM中的蒲公英MADS-box基因以及拟南芥MADS-box基因可以分为两类(I型和II型)(图1),而I型和II型成员可分为3个和14个亚科(图2)。TkMADS基因家族成员出现在所有17个亚科中,而TmMADS成员出现在16个亚科中(除BS亚科外)(图2B)。对比这三个物种的MADS-box基因家族,我们发现TKS和TM中的I型成员较拟南芥较少。
MADS-box基因家族基因是一类广泛存在于植物中的转录因子,高等植物中MADS基因由4个保守程度不一的区域组成,分别是MADS区、I(intervening)区、K (keratin-like)区和C末端(M-I-K-C domain structure)。 根据系统进化可以把MADS-box分为两类:I型和II型。大多数植物MADS基因,包括所有功能特异的真核生物MADS基因和动...
II型MADS-box基因广泛而不均匀地分布在所有染色体上,其中AGL6、AGL12、AGL15、AP3(DEF)、OsMADS32、PI、BS、SOC1和SVP亚家族的基因成员最分散,每个基因都独立分布在一个染色体上,而在其他五个II型MADS蛋白亚家族中,至少有两个基因家族成员在同一染色体上。 存在于Chr02、Chr03、Chr04、Chr09、Chr11和Chr15上...
在春化通路中,FLC转录因子作为MADS-box家族核心转录因子之一,是抑制开花的关键,决定着拟南芥冬季开花习性。 FLC通过直接与编码开花激活产物的基因对FLC基因上的表观遗传修饰方式来实现,由于H3K27me3对FLC的修饰标记可持续存在,冷暴露条件下FL的转录表达。
MADS盒基因家族 1. Plant MADS-box gene family plays an important role in controlling flower development. 植物的MADS盒基因家族在控制花发育过程中起重要作用,模式植物MADS盒基因结构、功能及作用机制对研究园艺植物MADS盒基因具有重要的理论指导意义。5
madsbox基因家族保守结构域 MADS box基因家族是一类转录因子,它们在植物的发育过程中起着关键作用。这些基因编码的蛋白质包含一个保守的结构域,称为MADS盒(MCM1,AGAMOUS,DEFICIENS和SRF)。这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达...
MADS-box家族作为一类在生物中广泛存在的转录因子,主要参与生长发育、次生代谢调控、激素信号转导,以及生物和非生物胁迫响应等过程,特别是在植物生殖系统发育中的作用尤为突出。水稻作为全球最重要的粮食作物之一,其生长发育以及逆境响应分子机制备受关注。综述MADS-box家...
MADS-box家族转录因子参与调控植物生长发育和生殖发育过程中的多种生物学功能,尤其在花序、花、果实的生长发育过程中起重要作用[13]。中 药火麻仁中共鉴定出39个MADS-box家族转录因子,其参与调控火麻仁的营养和生殖结构、开花时间、花器官形成[14],茶树中MADS-box蛋白CsGLO1和CsGLO2可形成二聚体调控第2轮花瓣和第...
1 MADS-box 转录因子 MADS-box 家族因其成员具有保守的 MADS 结构域而得名, 通过形成二聚体或其他复合体形式来调控基因表达[2].MADS-box 是由最先发现 具有 MADS 结构域的 4 种不同生物的首字母命名而来, 分别是酿酒酵母因子 MINICHROMOSOME MAINTENANCE 1(MCM1)[3], 拟南芥花同源异型因子 AGAMOUS[4], ...