conda安装MACS2一直报错,使用pip可以轻松安装 image.png
通常,你可以通过以下命令使用pip直接安装MACS2: bash pip3 install MACS2 4. 解压并安装MACS2(如果需要手动安装) 如果你下载了MACS2的源代码包(例如,一个.tar.gz文件),你需要先解压它,然后按照以下步骤进行安装: bash tar -xzvf MACS2-<version>.tar.gz cd MACS2-<version> python3 ...
一、安装MACS2 打算用pip安装。pip install MACS2 注释:这是第三个用pip安装的软件了,之前还有cutadapt和multiqc。但是失败了。。 ERROR: Command errored out with exit status 1: command: /data/software/anaconda3-202007/bin/python /data/software/anaconda3-202007/lib/python3.8/site-packages/pip install ...
百度教程说安装pip install mysqldb这在我的电脑上安装失败:Could not find a version that satisfies the requirement mysqldb (from versions : ) No matching distribution found for mysqldb所以应该:pip install MySQL-python报错:error python 2底数 python ...
看很多教程说macs2需要python2的环境,但是建立了python2.7的小环境,安装后一直报错.pip或者conda安装方式试过了都不行.现在macs2已经支持python3了,所有在python3环境下安装就行了.
#安装multiqcpip install multiqccd~/chip-seq/rawdata#测序原始数据路径fastqc *gz -o ../1fastqc#质控结果输出路径 -o ./1fastqcmultiqc ./1fastqc#mulutiqc 简单调用直需要跟 fastqc结果文件路径 rawdata质控基本统计 rawdata的接头信息 rawdata的序列质量 ...
均未成功,出现报错 图片.png 测试conda search bwa也没有成功,猜想是不是镜像源出了问题。 于是又pip安装pip install MACS2,安装成功 在运行程序时候,出现以下错误。 ValueError: numpy.ufunc size changed, may indicate binary incompatibility 搜寻答案,升级numpy即可pip install --upgrade numpy...
看很多教程说macs2需要python2的环境,但是建立了python2.7的小环境,安装后一直报错.pip或者conda安装方式试过了都不行. 现在macs2已经支持pyt...
MACS2 是一款常用的peak calling软件,可以鉴定ChIP-seq/Cut&Tag数据的peaks,本文简单介绍MACS2 的安装及peak calling的用法。 安装 MACS2 可以通过conda、pip的方法进行安装,也可以下载其源文件进行安装。以下展示conda的安装方法 #--prefix指定安装到`ChIPseq`环境中 ...
pip install MACS2 MACS2功能: macs2 callpeak 是macs2最主要的一个功能,能够利用bam文件寻找chip peak; macs2 callpeak 使用: # regular peak calling: macs2 callpeak -t ChIP.bam -c Control.bam -f BAM -g hs -n test -B -q 0.01