但这两种方法都无法对m6A进行定位,常用于课题研究初期。高通量测序目前主要以m6A-seq/MeRIP-seq为主,它是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。 MeRIP-seq将甲基化DNA 免疫共沉淀(methylated DNA immunoprecipitation, MeDIP)技术、RNA 结合蛋白免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)技术和RNA 测序(RNA sequencing,...
Arraystar解决方案:与以m6A抗体免疫共沉淀为基础的MeRIP或miCLIP等技术不同,芯片利用了RNA酶MazF对m6A的敏感性,提供了一种不依赖于抗体的系统性检测m6A的方法。 有限的分辨率 经典的m6A-seq技术可将m6A定位到三碱基至数十碱基的序列窗口内[13, 3, 4, 5]。一些改进方法(比如miCLIP-seq)通过将m6A抗体和其结合的RN...
易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症发生与发展、药物应答等研究领域;可应用...
scm6A-seq技术实现了单细胞内转录组和m6A甲基化组的同时测序(图1),在单个小鼠卵母细胞中可检测到超过一万个基因的表达,鉴定的m6A修饰区域呈现经典的RRAC保守基序特征,且技术重复性良好。通过与公共数据比较,该技术可在筛选到卵母细胞中保守的m6A修饰特征的同时,保留单细胞中的异质性修饰特征。 图片 图1. scm6A-s...
01 m6A RNA修饰测序 m6A RNA修饰测序(m6A-MeRIP-seq) 对m6A RNA甲基化,目前最流行的检测手段为m6A-Seq技术,适用于m6A RNA甲基化谱研究,快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m6A测序: m6A 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA) ...
m6A修饰在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色。因此meRIP-seq助力解决细胞分化,生物发育、疾病发生发展,热休克反应等生物学问题。 表观生物最新开发微量meRIP-seq技术,通过技术优化,大幅降低meRIP的样本要求量,500ng-20ug 总RNA即可满足实验要求。利用最新...
伯豪生物全称上海伯豪生物技术有限公司,在生命科学领域为科研工作者提供技术支持及服务、科研试剂产品的公司。主营业务:单细胞测序、单细胞核测序、单细胞ATAC测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、空间基因测序、空间转录组测序、FFPE空间转录组测序等,多组学科研技术服
01 m6ARNA修饰测序 m6A RNA修饰测序(m6A-meRIP-seq) 对m6A RNA甲基化,目前流行的检测手段为m6A-Seq技术,适用于m6A RNA甲基化谱研究,快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m6A测序: ● m6A 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA) ...
研究发现,m6A修饰在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色。因此meRIP-seq助力解决细胞分化,生物发育、疾病发生发展,热休克反应等生物学问题。 表观生物率先开发微量meRIP-seq技术,通过技术优化,大幅降低meRIP的样本要求量,500ng-20ug 总RNA即可满足实验要求...
Fig1F LC/MS 检测两组样本中整体的 m6A 修饰水平,FDG 高水平组的整体 m6A 修饰水平更高。 m6A-seq 和 RNA-seq 确定受 METTL3 调控的潜在靶基因 Fig 2d 展示样本中存在经典的 GGAC motif,fig 2e 展示 m6A peaks 在不同功能区域的分布。 Fig 3f 展示 m6A 修饰水平更高,基因表达水平也更高,fig 3h 展示...