今天所介绍的m6A-Atlas是一个全面高可信度数据库,专门用于解读m6A表观遗传组,m6A-Atlas具有可靠的m 6 A位点和定量表观转录组谱的高可信度集合。它还提供了保护,转录后机制的位点,假定的生物学功能和单个m 6 A位点的疾病关联以及感染过程中宿主和病毒的转录组。 m6A-Atlas的特点如下:(1)收集了从7种碱基分辨率...
m6A-Atlas是一个综合且全面的m6A数据库，拥有大量高可靠度的m6A位点信息，并标注了与转录和转录后机制（TF结合、RBP结合）的关联。这为研究m6A提供了宝贵的工具和资源。
m6A-Atlas的特点如下:(1)收集了从7种碱基分辨率技术中鉴定的442162个高置信度m6A位点,并从1363个高通量测序样本中估算出定量(而非二元)的表转录组谱。(2)收录人、小鼠、黑猩猩等7种脊椎动物m6A位点情况,以及HIV、KSHV、DENV等10种病毒的m6A图谱情况。(3)由表观转录组数据预测各个m6A位点的生物学功能,以及由疾病...
N 6-Methyladenosine (m6A) is the most prevalent RNA modification on mRNAs and lncRNAs. It plays a pivotal role during various biological processes and disease pathogenesis. We present here a comprehensive knowledgebase, m6A-Atlas, for unraveling the m6A epitranscriptome. Compared to existing databases...
m6A-Atlas is freely accessible at: www.xjtlu.edu.cn/biologicalsciences/atlas. 中文翻译: m6A-Atlas:用于解开 N6-甲基腺苷 (m6A) 表观转录组的综合知识库。 抽象的N 6 -甲基腺苷 (m 6 A) 是 mRNA 和 lncRNA 上最常见的 RNA 修饰。它在各种生物过程和疾病发病机制中发挥着关键作用。我们在此提供...
Estimating the prognosis of esophageal squamous cell carcinoma based on The Cancer Genome Atlas (TCGA) of m6A methylation- associated genesdoi:10.21037/jgo-21-686Yu PuXianfeng LuXueqin YangMingfang Xu
m6A-Atlas http://180.208.58.66/m6A-Atlas/ 以下,从5个方面介绍m6A-Atlas的使用功能。 01 search 这是数据库主页搜索功能。先在左侧选择对应的物种,系统自动选的是人类,然后输入自己所查询的关键词,这里我们以基因SOX4为例。搜索结果如下:基因SOX4有52个m6A修饰位点,每个位点的注释信息包括了基因组位置,基因位置...
今天所介绍的m6A-Atlas是一个全面高可信度数据库,专门用于解读m6A表观遗传组,m6A-Atlas具有可靠的m 6 A位点和定量表观转录组谱的高可信度集合。它还提供了保护,转录后机制的位点,假定的生物学功能和单个m 6 A位点的疾病关联以及感染过程中宿主和病毒的转录组。