1. m6A 甲基化的概念 "m6A甲基化"m6A甲基化是最常见的mRNA修饰形式,是指在RNA分子中,特别是在信使RNA (mRNA) 中,腺苷(A)的第六位碳上的氮原子N6的位置上加上甲基(-CH3)的化学修饰。这种修饰是转录后修饰的一种形式,即在RNA分子被合成后发生的改变。 2. m6A 甲基化的动态过程 m6A 甲基化是一个动态可逆...
TREX复合体是 mRNA 输出的主要参与者,它会被招募到m6A修饰的mRNA上,以促进mRNA核输出。此外,YTHDC1、FMRP等也能通过识别m6A修饰的mRNA,并介导mRNA的核输出。(2)m6A甲基化调节mRNA翻译 ①促进mRNA翻译 YTHDF1招募真核翻译起始因子3(eIF3),并将m6A修饰的mRNA与核糖体偶联,而eIF3可以直接结合5‘UTR中的m6A...
6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)——即RNA中腺苷酸(A)第六位N上发生的甲基化,是真核生物mRNA中最丰富的表观转录组学修饰,占所有腺苷的0.1%-0.4%左右[1]。虽然上世纪70年代即被发现,但直到近年酶学和高通量检测技术的发展才使得m6A动力学与真核生物的各种疾病、发育和细胞过程真正联系起来。目前在超...
② 抑制mRNA翻译 FMR1是小鼠和人类细胞中的m6A阅读器,优先与含有m6A修饰的mRNA相互作用,通过阻止核糖体易位来抑制翻译。有趣的是,FMR1与YTHDF1可竞争性结合一些相同的靶点,进而在不同的环境条件下调控翻译平衡。 (3)m6A甲基化调节mRNA稳定性和降解 m6A可能通过诱导结合有mRNA的蛋白计入降解机制或去除使mRNA稳定的蛋白...
甲基化转移酶(methyltransferase)也叫Writers,是一类重要的催化酶,能够让mRNA上的碱基发生m6A甲基化修饰。METTL3、METTL14、WTAP和KIAA1492都属于m6A甲基化转移酶的核心蛋白。这些蛋白并不是各自孤立的,而是会形成复合物(complex)共同行使催化功能。由于酵母和线虫等生物缺少这四种核心蛋白...
高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; 重复性高:IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差; ...
2022年8月,美国俄克拉荷马州立大学Ramanjulu Sunkar团队和宾夕法尼亚大学Brian D. Gregory团队合作以“mRNA N6-methyladenosine is critical for cold tolerance in Arabidopsis”为题在《the plant journal》杂志发表研究论文,该研究以拟南芥为对象,通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)揭示了表观转录组(m6A甲基化)在...
该研究对于解析mRNA m6A甲基化转录组的分布特异性以及外显子结构体系对局部mRNA包装来抑制其被调控机制接触,具有重要意义。研究团队设计了一种针对m6A甲基化的大规模并行检测试验(Massively Parallel Assay for m6A, MPm6A)来试图回答这样一个直观的问题:如果我们通过质粒表达细胞内生的m6A位点附近的序列,这些位点...
2022年8月,美国俄克拉荷马州立大学Ramanjulu Sunkar团队和宾夕法尼亚大学Brian D. Gregory团队合作以“mRNA N6-methyladenosine is critical for cold tolerance in Arabidopsis”为题在《the plant journal》杂志发表研究论文,该研究以拟南芥为对象,通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)揭示了表观转录组(m6A甲基化)在...
m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; ...