1、m6A修饰 N6-腺苷酸甲基化(m6A)是迄今为止最普遍最丰富的RNA甲基化修饰,是指RNA腺苷酸的第6位氮被甲基化,随着特异性抗体的研发及高通量测序的快速发展,几乎所有类型的RNA上均发现m6A修饰。1997年第1个m6A甲基转移酶样蛋白3(METTL3)的成功克隆以及2011年第1个m6A去甲基化酶肥胖相关蛋白(FTO)的确定,表明m6A甲...
m6A 的修饰过程是由 S-腺苷甲硫氨酸提供甲基,在多聚蛋白甲基转移酶复合物介导下发生的腺苷酸第六位氮原子上的甲基化修饰。 m6A 修饰的化学反应 m6A 修饰的整个过程是由一系列蛋白参与的。为了方便理解,研究人员将这些蛋白形容为 Writer,Eraser 和 Reader,分别指...
m6A修饰主要发生在RRACH (R = G or A and H = A,C, or U)这类motif上,这类motif主要在终止密码子和3’UTR处富集,即m6A主要发生在终止密码子和3’UTR附近(An and Duan 2022)。m6A修饰广泛存在于各类生物中,包括病毒、酵母、植物和人类等。该修饰对细胞行使各种功能起着重要作用,如结合其他reader蛋白,促...
为了直接评估转录后 m6A 修饰的程度,他们计算了稳态 RNA 的 m6A 水平与新合成 RNA 的 m6A 水平之比,用以反映转录后 m6A 修饰的程度。 结果发现大多数被检测到基因的 RNA 在转录后被 m6A 进一步修饰,而新生 RNA 则较少被 m6A 修饰。因此,m6A 修饰的动力学...
circRNA m6A甲基化PCR验证: (1)环状RNA m6A修饰验证:m6A抗体富集发生m6A修饰的RNA + RNase RNA消化线性RNA,保留circRNA +circRNA反向接合位点设计引物 (2)基于MazF酶处理的circRNA m6ACA位点检测:circRNA m6ACA位点预测 + RNase R去线性RNA + MazF酶处理 + m6ACA位点PCR检测...
在对牛的研究中,m6A甲基化转移酶METTL3对成肌细胞增殖具有抑制作用,并能促进细胞分化;它还能通过影响TM4SF1稳定性来调控成肌细胞发育。YTHDF2介导的TM4SF1 mRNA降解也依赖于m6A修饰。成年牛背最长肌中m6A去甲基化酶(FTO和ALKBH5)的表达显著高于新生牛,而m6A甲基转移酶(METTL3、METTL14和WTAP)的表达则较低。在...
m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式,它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq(高通量测序法)作为m6A修饰的检测方法,其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在;能够明确每个基因的修饰水平,进行组与组之间比较等优势。接下来就让小编带大家详细了解m6A和MeRIP-seq。
2021年,林辰涛课题组在Nature Plants(2021)(《自然-植物》)发文报道了蓝光诱导的蓝光受体CRY2通过蓝光诱导的液-液相分离招募m6A“编码器(writer)”MTA复合体进入CRY2的液相中,提高MTA蛋白在CRY2的液相中的浓度而促进m6A修饰,调节m6A修饰的生物钟节律基因mRNA稳定,维持植物生物钟节律。
在这些方法中，DART-seq要求的RNA起始量要求是相对比较低的，为10 ng 总RNA，而且可以用于单个细胞中m6A的鉴定。由于DART-seq实验过程需要体外转基因表达APOBEC1-YTH，因此，它不适用于研究体内系统（早期胚胎发育过程）中m6A修饰的分析。得益于作者在低DNA/细胞起始量ChIP-seq实验方面长期积累的经验，他们开发了适用...