01-M20 Seq绘制单核分辨率的泛癌景观 SnHH-seq(收录于M20 Seq)原理和流程如图1所示。这一方法基于随机引物原理,将冷冻临床肿瘤样本解离、获得单细胞核并固定后,通过随机引物对核内RNA进行原位逆转录并加poly(A)尾,然后通过微流控液滴平台捕获cDNA,同时给cDNA加上细胞标签,随后进行建库测序。
据M20 Genomic公司官网显示，M20 Seq技术具有以下六大优势：全长转录组测序。基于随机引物原理可对RNA全长进行测序，进行基因突变、基因融合、拷贝数变异、非编码RNA、可变剪接等检测，扩展单细胞测序技术在肿瘤临床检测方面的应用。全样本类型。不仅可用于新鲜组织、冻存组织，还可以解决FFPE样本难以进行单细胞转录组测序...
Genebody分布图显示,基于oligo(dT)引物的snFFPE-Seq显示出明显的3’端偏好;使用snPATHO-seq的探针技术(10X Flex)显示出5’端偏好;而snRandom-seq数据5’-3’覆盖均一(图3j),表明随机引物与RNA是均匀结合,额外的oligo(dT)引物对FFPE样本的RNA捕获不佳。对于单细胞核水平上的覆盖率,snRandom-seq的覆盖率远高于...
m20测序原理 你想问的可能是MGISEQ-200(M20)测序仪的原理,它主要基于联合探针锚定聚合技术(cPAS)和改进的DNA纳米球(DNB)技术,具体原理如下: DNA纳米球(DNB)技术。 文库构建:将基因组DNA或其他来源的DNA片段化处理,然后在片段两端连接上特定的接头序列,形成文库。这些接头序列可以与后续反应中的引物或探针互补结合...
基于M20 Seq技术,M20 Genomics同步发布其首个全样本高通量单细胞测序产品VITA系列(下称“VITA”)。VITA突破性地实现了全样本类型、全物种、全长RNA的(超)高通量单细胞转录组测序,不仅大幅度地提升了单细胞测序技术的检测灵敏度,同时将极大地拓宽单细胞技术的应用领域。 01/ 单细胞测序技术的现状 长期以来,研究人员...
技术原理及流程 snRandom-seq主要工作流程如图1所示。首先,获取的FFPE组织进行脱蜡复水、细胞核分离、以及透化。为了避免基因组污染,使用阻断引物与裸露的单链DNA结合,通过多次退火和延伸进行原位阻断。然后,随机引物和oligo(dT)引物进入细胞核与RNA结合,对全转录组的RNA分子进行原位逆转录。通过末端转移酶(TdT)将Poly...
技术原理及流程 snRandom-seq 主要工作流程如图 1 所示。首先,获取的 FFPE 组织进行脱蜡复水、细胞核分离、以及透化。为了避免基因组污染,使用阻断引物与裸露的单链 DNA 结合,通过多次退火和延伸进行原位阻断。然后,随机引物和 oligo(dT)引物进入细胞核与 RNA 结合,对全转录组的 RNA 分子进行原位逆转录。通过末端...
M20 seq技术做到了全转录组、全样本类型、全物种的覆盖,且具备高灵敏度与超高通量的检测实力。其不仅降低了单细胞测序技术的使用成本,更可以让科研和临床人员可以对医学样本库中的冻存、FFPE样本开展测序工作,推动单细胞技术在肿瘤、生殖、衰老和免疫等领域的应用。
技术原理及流程 snRandom-seq 主要工作流程如图 1 所示。首先,获取的 FFPE 组织进行脱蜡复水、细胞核分离、以及透化。为了避免基因组污染,使用阻断引物与裸露的单链 DNA 结合,通过多次退火和延伸进行原位阻断。然后,随机引物和 oligo(dT)引物进入细胞核与 RNA 结合,对全转录组的 RNA 分子进行原位逆转录。通过末端...