刘意. 甘薯活性长末端重复序列 (LTR) 转座子的 全基因组分离与鉴定. https://www.koushare.com/video/details/8760. 宝鸡. 复制 APA 刘意. 2020-11-17 00:00. 甘薯活性长末端重复序列 (LTR) 转座子的 全基因组分离与鉴定. 宝鸡. https://www.koushare.com/video/details/8760 复制 下载 bib文件 0...
摘要在水稻第四号染色体的长臂上鉴定了一个结构完整的Ty3型逆转录转座子RIRE10。RIRE10两LTR间的 中间区域在gag2pol的上游还包含另一个开放阅读框。通过RT2PCR与Northern印迹杂交检测到来自LTR区的转录 产物;根据点杂交结果,鉴定出包含中间区域的RIRE10成员的个数以及LTR区的拷贝数。除了65个完整的逆转 ...
件分析得到一个典型LTR反转录转座子Ph—LTR1,并对其进行鉴定及插入时间的估算,结果表明 . LTR1属于Ty3-gypsy类反转录转座子,其两端长末端重复序列同源性高达98.78%,插入时间约为47.9 万年,是一个自身具备转座条件的年轻反转录转座子,并且极有可能具有潜在活性。采用同源性搜索方 ...
逆转座子 果梅LTR类逆转座子序列特征及遗传多样性的SSAP分析 马铃薯(Solanum tuberosum L.)全基因组水平上LTR-逆转座子的鉴定与进化分析 浅谈清辉园花台 转座子-PPT(精) 第十二章转座子ppt课件 水稻全长LTR类逆转座子的鉴定和结构分析 格式...
Acta Prataculturae Sinica,2021,30(5):121−133.无芒隐子草全基因组水平全长 LTR反转录转座子鉴定及其中断基因分析王艺蒙,马甜甜,欧阳子凤,张吉宇*(草地农业生态系统国家重点实验室,兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020)摘要:LTR 反转录转座子是植物基因组内大量可移动的遗传因子,是基因组的重要成分之一。
通过分析,我们估算出毛竹LTR逆转座子插入基因组的时间主要分布于200-500万年前,晚于毛竹基因组 四倍化的时间。研究还发现了29个位于全长LTR逆转座子内部、有转录组序列支持的蛋 白编码基因,这些 毛竹基因均不符合所在基因组区段的毛竹 一水稻基因共线性关系,且位于LTR逆转座子内部的基因与存在 于染色体其他位置...
转座子的鉴定和描述是研究水稻基因组生物学功能的一个基础;采用一个较新的逆转座子预测软件LTR_FINDER从水稻品种日本晴372Mb基因组(TIGR Release 5)中鉴定到6,460个全长LTR逆转座子,并根据其内部主要结构域的有无进行了详细分类,共分成29种结构区域类型(SDCs).关键词: 水稻基因组;逆转座子;LTR元件;结构 DOI...
马铃薯(SolanumtuberosumL.)全基因组水平上LTR-逆转座子的鉴定与进化分析
萝卜LTR逆转座子分离与鉴定将为研究萝卜基因组进化和起源提供理论依据,相关标记开发能够为萝卜分子水平的遗传育种和品种改良提供一种新的技术手段.本研究根据LTRs逆转录酶序列的保守区设计逆转录酶引物,通过PCR扩增技术在萝卜基因组中克隆和分离得到了Ty1-copia和Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列,并对其核苷酸同源性...
转座子的鉴定和描述是研究水稻基因组生物学功能的一个基础;采用一个较新的逆转座子预测软件LTR_FINDER从水稻品种日本晴372Mb基因组(TIGR Release 5)中鉴定到6,460个全长LTR逆转座子,并根据其内部主要结构域的有无进行了详细分类,共分成29种结构区域类型(SDCs). ...