LSF支持在作业脚本里面设置提交选项,每一个提交选项可以写到独立的行里,使用标签#BSUB作为提交选项的标识。提交选项和提交命令行没有任何区别。 $ cat job.sh #!/bin/bash #BSUB -R 'select[mem>1G]' #BSUB -R 'rusage[mem=512M]' sleep 10 提交的时候需要注意,bsub需要从标准输入中提取作业脚本,分析相关...
bsub <options> -n 指定需要的CPU数量 -R 指定任务需要的内存大小 , 例如 bsub -n 4 -R "rusage[mem=2048]" command -q 指定提交队列 -J 指定JOB 名称 -sp 设置作业优先级, 范围是0-100 -o 将作业输出到标准文件, 一般是log文件 -e 错误输出文件 -m 指定作业运行的节点 -Ip 指定以交互式方式执...
若作业因计算节点故障而失败，LSF提供bsub -r选项，实现作业自动重新运行。当作业提交时，使用此选项，作业将具有可重新运行属性。LSF监控作业执行节点状态，一旦发现节点失效，将作业调度到健康节点重新运行。通用需求设置使用bsub -R命令指定复杂的资源需求，LSF将根据需求调度资源。需求指定分为不同部分，以...
#BSUB -R"span[ptile=20]"### ask for 20 cores per node #BSUB -W 10:00### set walltime limit: hh:mm #BSUB -o stdout_%J.out### Specify the output and error file. %J is the job-id #BSUB -e stderr_%J.err### -o and -e mean append, -oo and -eo mean overwrite #here...
bsub [options] command [argument] 2.2 相关参数: -q 选择作业提交的队列queue -i 指定输入文件 -I 交互模式,此时终端不能输入 -J 指定作业名称 -n 指定作业需要的CPU核心数,LSF中一般称之为slot -R span[hosts=1] 指定作业只能在单个节点运行,不能跨节点(跨节点作业需要MPI支持,生物中比较少),-R 可以...
通用资源需求：使用bsub R命令指定复杂的资源需求。并行作业资源描述：使用cu资源描述节点指定物理结构关系，帮助选择距离更近的计算节点。NUMA绑定：使用affinity选项提升程序性能。指派GPU资源：使用bsub gpu选项指定所需GPU资源。指定计算节点：使用bsub m选项强制将作业调度到特定节点，或使用hostfile选项指定...
3. 高级用法:除了基本用法之外,lsf还提供了许多高级功能和选项,用于更灵活地管理作业和计算资源。例如,可以使用`bsub`命令的`-R`选项指定作业依赖关系,使用`bqueues`命令查看队列状态,使用`bhosts`命令查看主机状态等。 4. 配置和管理:为了正常使用lsf命令,需要进行一些配置和管理工作。首先,需要安装和配置lsf软件包...
bsub命令用于提交任务到LSF系统。使用bsub命令可以指定任务的资源需求、运行时间限制、标准输出和错误输出等参数。以下是bsub命令的常用选项: •-J:指定任务的名称。 •-n:指定任务所需的CPU核心数量。 •-R:指定任务所需的资源要求,如内存、硬盘空间等。 •-W:指定任务的运行时间限制。 •-o:指定任务的...
bsub -R "select[minCpuPlatform==Intel_Sandy_Bridge || minCpuPlatform==Intel_Cascade_Lake]" myjob bsub myjob 您还可以将minCpuPlatform设置为数字资源,使用不同的值来表示不同的 CPU 平台,然后根据此数字需求提交作业。 例如,如果将以下数字用于不同的 CPU 平台: ...
除了以上提到的命令,LSF还提供了其他一些命令,如bsub用于提交作业,bkill用于取消作业等。 总之,LSF的命令可以帮助用户有效地管理和调度集群中的作业和资源,提高计算效率和资源利用率。 一、什么是lsf命令 lsf是Linux操作系统中的一个命令,用于列出指定目录下的文件和子目录。