bsub -J jobb -app bnormal -w ended(jobd_id) jobb.sh 依次类推,更多级的层级也可以来进行控制,但是相对管理起来比较麻烦。 五、bsub的job顺序执行 当前一个job的bsub的job后,下一个job要严格在上一个job完成后再执行。我们上面第二节就是一种方法,下一个job建立第一个job的依赖关系。 如果第二个job是...
#BSUB -J Jobname //指定作业名,JobName用于在使用bjobs查看任务时,区分不同的Job #BSUB -n Number //指定作业所需的进程数 #BSUB -o %J.out //J.out是程序运行结果的标准输出文件,J就是前面的JobName #BSUB -e %J.err //同上,错误输出文件 #BSUB -R span[ptile=number] //请求使用每个节点中的...
LSF 调度系统的默认提交作业命令为:bsub。 bjobs 等效于 PBS 中的 qstat bsub 等效于 PBS 中的 qsub bkill 等效于 PBS 中的 qdel 提交任务的脚本(a.lsf 或 a.sh)为: #!/bin/sh#BSUB -J task#BSUB -n 1python a.py 其中,-J 表示作业名称,-n 表示规定 CPU 的核心数。 有的系统中会强制要求提供...
bsub [options] command [argument] 2.2 相关参数: -q 选择作业提交的队列queue -i 指定输入文件 -I 交互模式,此时终端不能输入 -J 指定作业名称 -n 指定作业需要的CPU核心数,LSF中一般称之为slot -R span[hosts=1] 指定作业只能在单个节点运行,不能跨节点(跨节点作业需要MPI支持,生物中比较少),-R 可以...
bsub命令用于提交任务到LSF系统。使用bsub命令可以指定任务的资源需求、运行时间限制、标准输出和错误输出等参数。以下是bsub命令的常用选项: •-J:指定任务的名称。 •-n:指定任务所需的CPU核心数量。 •-R:指定任务所需的资源要求,如内存、硬盘空间等。 •-W:指定任务的运行时间限制。 •-o:指定任务的...
bsub < blastn.lsf 脚本中每行内容解释: -J 指定作业名称 -n 作业使用核心数,LSF中一般称之为slot -R span[hosts=1] 指定作业只能在单个节点运行,不能跨节点(跨节点作业需要MPI支持,生物中比较少),-R 可以使得作业在需要满足某种条件的节点上运行 ...
bsub < blastn.lsf 脚本中每行内容解释: -J 指定作业名称 -n 作业使用核心数,LSF中一般称之为slot -R span[hosts=1] 指定作业只能在单个节点运行,不能跨节点(跨节点作业需要MPI支持,生物中比较少),-R 可以使得作业在需要满足某种条件的节点上运行 ...
#BSUB -J testJob #BSUB -n 28 #BSUB -o %J.out #BSUB -e %J.err #BSUB -q normal echo "111" 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. -J 作业名称 -n 作业至少需要的CPU核数(28的倍数),也可以是范围(表示方法如[28,56]) -o 标准输出文件 ...
工作陣列可以作為單一單元或個別工作或工作群組來提交、控制及監視。 從工作陣列提交的每一個工作都與工作陣列共用相同的工作 ID ,並使用陣列索引進行唯一參照。 建立工作陣列時,會定義工作陣列的維度和結構。 語法 用來建立工作陣列的 bsub 語法如下: bsub -J "arrayName[indexList, ...]" myJob 其中: -J ...
smp_high (选择队列)#BSUB -app gaussia n 应用)#BSUB -o %J.out(结果输出文件,以作业号为文件名)#BSUB -e %J.err(错误输出文件,以作业号为文件名)#BSUB -n 12(计算核心的数量)#BSUB -R "spanhosts=1(" 12个计算核心在一台机器上)g09 TS3-4_Gromacs (把下面内容编写成脚本)#BSUB -q ...